Protein–RNA interactions for Protein: Q3TBL6

Tnfaip8l3, Tumor necrosis factor alpha-induced protein 8-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfaip8l3Q3TBL6 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Tnfaip8l3Q3TBL6 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tnfaip8l3Q3TBL6 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tnfaip8l3Q3TBL6 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tnfaip8l3Q3TBL6 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tnfaip8l3Q3TBL6 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tnfaip8l3Q3TBL6 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tnfaip8l3Q3TBL6 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tnfaip8l3Q3TBL6 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tnfaip8l3Q3TBL6 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tnfaip8l3Q3TBL6 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tnfaip8l3Q3TBL6 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tnfaip8l3Q3TBL6 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tnfaip8l3Q3TBL6 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tnfaip8l3Q3TBL6 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tnfaip8l3Q3TBL6 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tnfaip8l3Q3TBL6 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tnfaip8l3Q3TBL6 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tnfaip8l3Q3TBL6 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnfaip8l3Q3TBL6 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnfaip8l3Q3TBL6 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnfaip8l3Q3TBL6 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnfaip8l3Q3TBL6 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnfaip8l3Q3TBL6 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnfaip8l3Q3TBL6 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnfaip8l3Q3TBL6 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnfaip8l3Q3TBL6 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnfaip8l3Q3TBL6 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnfaip8l3Q3TBL6 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnfaip8l3Q3TBL6 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnfaip8l3Q3TBL6 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnfaip8l3Q3TBL6 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnfaip8l3Q3TBL6 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnfaip8l3Q3TBL6 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnfaip8l3Q3TBL6 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnfaip8l3Q3TBL6 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnfaip8l3Q3TBL6 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnfaip8l3Q3TBL6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnfaip8l3Q3TBL6 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnfaip8l3Q3TBL6 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnfaip8l3Q3TBL6 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnfaip8l3Q3TBL6 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnfaip8l3Q3TBL6 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnfaip8l3Q3TBL6 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnfaip8l3Q3TBL6 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnfaip8l3Q3TBL6 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnfaip8l3Q3TBL6 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnfaip8l3Q3TBL6 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnfaip8l3Q3TBL6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnfaip8l3Q3TBL6 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnfaip8l3Q3TBL6 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnfaip8l3Q3TBL6 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnfaip8l3Q3TBL6 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Tnfaip8l3Q3TBL6 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnfaip8l3Q3TBL6 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnfaip8l3Q3TBL6 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnfaip8l3Q3TBL6 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnfaip8l3Q3TBL6 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnfaip8l3Q3TBL6 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnfaip8l3Q3TBL6 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnfaip8l3Q3TBL6 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnfaip8l3Q3TBL6 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tnfaip8l3Q3TBL6 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tnfaip8l3Q3TBL6 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tnfaip8l3Q3TBL6 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Tnfaip8l3Q3TBL6 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Tnfaip8l3Q3TBL6 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tnfaip8l3Q3TBL6 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tnfaip8l3Q3TBL6 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tnfaip8l3Q3TBL6 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnfaip8l3Q3TBL6 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnfaip8l3Q3TBL6 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnfaip8l3Q3TBL6 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnfaip8l3Q3TBL6 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnfaip8l3Q3TBL6 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnfaip8l3Q3TBL6 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnfaip8l3Q3TBL6 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnfaip8l3Q3TBL6 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnfaip8l3Q3TBL6 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnfaip8l3Q3TBL6 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tnfaip8l3Q3TBL6 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tnfaip8l3Q3TBL6 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tnfaip8l3Q3TBL6 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tnfaip8l3Q3TBL6 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tnfaip8l3Q3TBL6 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tnfaip8l3Q3TBL6 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.2 ms