Protein–RNA interactions for Protein: Q30D77

Col24a1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col24a1Q30D77 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Col24a1Q30D77 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Col24a1Q30D77 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Col24a1Q30D77 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Col24a1Q30D77 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Col24a1Q30D77 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Col24a1Q30D77 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Col24a1Q30D77 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Col24a1Q30D77 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Col24a1Q30D77 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Col24a1Q30D77 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Col24a1Q30D77 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Col24a1Q30D77 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Col24a1Q30D77 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Col24a1Q30D77 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Col24a1Q30D77 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Col24a1Q30D77 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Col24a1Q30D77 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Col24a1Q30D77 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Col24a1Q30D77 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Col24a1Q30D77 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Col24a1Q30D77 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Col24a1Q30D77 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Col24a1Q30D77 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Col24a1Q30D77 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Col24a1Q30D77 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Col24a1Q30D77 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Col24a1Q30D77 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Col24a1Q30D77 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Col24a1Q30D77 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Col24a1Q30D77 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Col24a1Q30D77 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Col24a1Q30D77 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Col24a1Q30D77 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Col24a1Q30D77 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Col24a1Q30D77 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Col24a1Q30D77 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Col24a1Q30D77 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Col24a1Q30D77 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Col24a1Q30D77 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Col24a1Q30D77 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Col24a1Q30D77 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Col24a1Q30D77 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Col24a1Q30D77 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Col24a1Q30D77 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Col24a1Q30D77 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Col24a1Q30D77 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Col24a1Q30D77 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Col24a1Q30D77 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Col24a1Q30D77 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Col24a1Q30D77 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Col24a1Q30D77 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Col24a1Q30D77 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Col24a1Q30D77 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Col24a1Q30D77 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Col24a1Q30D77 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Col24a1Q30D77 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Col24a1Q30D77 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Col24a1Q30D77 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Col24a1Q30D77 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Col24a1Q30D77 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Col24a1Q30D77 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Col24a1Q30D77 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Col24a1Q30D77 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Col24a1Q30D77 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Col24a1Q30D77 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Col24a1Q30D77 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Col24a1Q30D77 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Col24a1Q30D77 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Col24a1Q30D77 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Col24a1Q30D77 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Col24a1Q30D77 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Col24a1Q30D77 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Col24a1Q30D77 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Col24a1Q30D77 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Col24a1Q30D77 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Col24a1Q30D77 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Col24a1Q30D77 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Col24a1Q30D77 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Col24a1Q30D77 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Col24a1Q30D77 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Col24a1Q30D77 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Col24a1Q30D77 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Col24a1Q30D77 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Col24a1Q30D77 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Col24a1Q30D77 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Col24a1Q30D77 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Col24a1Q30D77 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Col24a1Q30D77 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Col24a1Q30D77 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Col24a1Q30D77 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Col24a1Q30D77 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Col24a1Q30D77 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Col24a1Q30D77 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Col24a1Q30D77 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Col24a1Q30D77 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Col24a1Q30D77 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Col24a1Q30D77 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Col24a1Q30D77 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Col24a1Q30D77 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms