Protein–RNA interactions for Protein: Q2VLH6

Cd163, Scavenger receptor cysteine-rich type 1 protein M130, mousemouse

Predictions only

Length 1,121 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd163Q2VLH6 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cd163Q2VLH6 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cd163Q2VLH6 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cd163Q2VLH6 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cd163Q2VLH6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cd163Q2VLH6 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cd163Q2VLH6 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cd163Q2VLH6 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cd163Q2VLH6 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cd163Q2VLH6 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cd163Q2VLH6 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cd163Q2VLH6 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cd163Q2VLH6 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cd163Q2VLH6 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cd163Q2VLH6 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cd163Q2VLH6 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Cd163Q2VLH6 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Cd163Q2VLH6 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Cd163Q2VLH6 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cd163Q2VLH6 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cd163Q2VLH6 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Cd163Q2VLH6 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cd163Q2VLH6 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cd163Q2VLH6 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cd163Q2VLH6 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cd163Q2VLH6 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cd163Q2VLH6 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cd163Q2VLH6 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cd163Q2VLH6 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cd163Q2VLH6 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cd163Q2VLH6 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cd163Q2VLH6 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cd163Q2VLH6 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cd163Q2VLH6 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cd163Q2VLH6 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cd163Q2VLH6 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cd163Q2VLH6 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cd163Q2VLH6 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cd163Q2VLH6 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Cd163Q2VLH6 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cd163Q2VLH6 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cd163Q2VLH6 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cd163Q2VLH6 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cd163Q2VLH6 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cd163Q2VLH6 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cd163Q2VLH6 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cd163Q2VLH6 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cd163Q2VLH6 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cd163Q2VLH6 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cd163Q2VLH6 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cd163Q2VLH6 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cd163Q2VLH6 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cd163Q2VLH6 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cd163Q2VLH6 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cd163Q2VLH6 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cd163Q2VLH6 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cd163Q2VLH6 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cd163Q2VLH6 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cd163Q2VLH6 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cd163Q2VLH6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cd163Q2VLH6 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Cd163Q2VLH6 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cd163Q2VLH6 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cd163Q2VLH6 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cd163Q2VLH6 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cd163Q2VLH6 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cd163Q2VLH6 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Cd163Q2VLH6 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cd163Q2VLH6 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cd163Q2VLH6 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cd163Q2VLH6 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cd163Q2VLH6 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cd163Q2VLH6 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cd163Q2VLH6 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cd163Q2VLH6 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cd163Q2VLH6 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cd163Q2VLH6 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cd163Q2VLH6 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cd163Q2VLH6 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cd163Q2VLH6 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Cd163Q2VLH6 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cd163Q2VLH6 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Cd163Q2VLH6 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cd163Q2VLH6 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cd163Q2VLH6 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cd163Q2VLH6 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cd163Q2VLH6 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cd163Q2VLH6 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cd163Q2VLH6 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cd163Q2VLH6 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cd163Q2VLH6 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cd163Q2VLH6 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Cd163Q2VLH6 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cd163Q2VLH6 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cd163Q2VLH6 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cd163Q2VLH6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cd163Q2VLH6 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cd163Q2VLH6 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cd163Q2VLH6 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cd163Q2VLH6 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms