Protein–RNA interactions for Protein: Q2TV84

Trpm1, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm1Q2TV84 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Trpm1Q2TV84 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Trpm1Q2TV84 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Trpm1Q2TV84 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Trpm1Q2TV84 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Trpm1Q2TV84 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Trpm1Q2TV84 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Trpm1Q2TV84 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Trpm1Q2TV84 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Trpm1Q2TV84 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Trpm1Q2TV84 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Trpm1Q2TV84 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Trpm1Q2TV84 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Trpm1Q2TV84 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Trpm1Q2TV84 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Trpm1Q2TV84 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Trpm1Q2TV84 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Trpm1Q2TV84 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Trpm1Q2TV84 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
Trpm1Q2TV84 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Trpm1Q2TV84 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Trpm1Q2TV84 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Trpm1Q2TV84 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Trpm1Q2TV84 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Trpm1Q2TV84 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Trpm1Q2TV84 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Trpm1Q2TV84 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
Trpm1Q2TV84 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
Trpm1Q2TV84 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Trpm1Q2TV84 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Trpm1Q2TV84 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC29.51■■■□□ 2.32
Trpm1Q2TV84 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Trpm1Q2TV84 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
Trpm1Q2TV84 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Trpm1Q2TV84 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Trpm1Q2TV84 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Trpm1Q2TV84 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Trpm1Q2TV84 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Trpm1Q2TV84 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Trpm1Q2TV84 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Trpm1Q2TV84 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Trpm1Q2TV84 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Trpm1Q2TV84 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Trpm1Q2TV84 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Trpm1Q2TV84 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Trpm1Q2TV84 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Trpm1Q2TV84 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Trpm1Q2TV84 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Trpm1Q2TV84 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Trpm1Q2TV84 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Trpm1Q2TV84 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Trpm1Q2TV84 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Trpm1Q2TV84 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Trpm1Q2TV84 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Trpm1Q2TV84 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Trpm1Q2TV84 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Trpm1Q2TV84 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
Trpm1Q2TV84 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Trpm1Q2TV84 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Trpm1Q2TV84 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Trpm1Q2TV84 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Trpm1Q2TV84 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Trpm1Q2TV84 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Trpm1Q2TV84 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Trpm1Q2TV84 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Trpm1Q2TV84 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Trpm1Q2TV84 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Trpm1Q2TV84 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Trpm1Q2TV84 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
Trpm1Q2TV84 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Trpm1Q2TV84 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Trpm1Q2TV84 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Trpm1Q2TV84 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Trpm1Q2TV84 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Trpm1Q2TV84 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Trpm1Q2TV84 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Trpm1Q2TV84 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Trpm1Q2TV84 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Trpm1Q2TV84 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Trpm1Q2TV84 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Trpm1Q2TV84 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
Trpm1Q2TV84 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Trpm1Q2TV84 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Trpm1Q2TV84 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Trpm1Q2TV84 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Trpm1Q2TV84 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
Trpm1Q2TV84 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Trpm1Q2TV84 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Trpm1Q2TV84 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Trpm1Q2TV84 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
Trpm1Q2TV84 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Trpm1Q2TV84 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Trpm1Q2TV84 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
Trpm1Q2TV84 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Trpm1Q2TV84 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Trpm1Q2TV84 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
Trpm1Q2TV84 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Trpm1Q2TV84 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Trpm1Q2TV84 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Trpm1Q2TV84 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms