Protein–RNA interactions for Protein: Q1ERP8

Cd300lg, CMRF35-like molecule 9, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300lgQ1ERP8 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cd300lgQ1ERP8 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cd300lgQ1ERP8 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cd300lgQ1ERP8 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cd300lgQ1ERP8 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cd300lgQ1ERP8 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cd300lgQ1ERP8 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cd300lgQ1ERP8 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cd300lgQ1ERP8 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cd300lgQ1ERP8 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cd300lgQ1ERP8 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cd300lgQ1ERP8 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cd300lgQ1ERP8 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cd300lgQ1ERP8 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cd300lgQ1ERP8 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cd300lgQ1ERP8 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cd300lgQ1ERP8 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Cd300lgQ1ERP8 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Cd300lgQ1ERP8 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cd300lgQ1ERP8 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cd300lgQ1ERP8 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cd300lgQ1ERP8 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cd300lgQ1ERP8 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cd300lgQ1ERP8 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cd300lgQ1ERP8 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cd300lgQ1ERP8 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Cd300lgQ1ERP8 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cd300lgQ1ERP8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cd300lgQ1ERP8 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cd300lgQ1ERP8 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cd300lgQ1ERP8 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cd300lgQ1ERP8 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cd300lgQ1ERP8 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cd300lgQ1ERP8 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cd300lgQ1ERP8 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cd300lgQ1ERP8 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cd300lgQ1ERP8 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cd300lgQ1ERP8 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cd300lgQ1ERP8 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cd300lgQ1ERP8 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cd300lgQ1ERP8 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cd300lgQ1ERP8 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cd300lgQ1ERP8 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cd300lgQ1ERP8 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cd300lgQ1ERP8 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Cd300lgQ1ERP8 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Cd300lgQ1ERP8 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cd300lgQ1ERP8 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cd300lgQ1ERP8 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Cd300lgQ1ERP8 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cd300lgQ1ERP8 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cd300lgQ1ERP8 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cd300lgQ1ERP8 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cd300lgQ1ERP8 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cd300lgQ1ERP8 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Cd300lgQ1ERP8 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cd300lgQ1ERP8 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cd300lgQ1ERP8 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cd300lgQ1ERP8 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cd300lgQ1ERP8 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cd300lgQ1ERP8 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cd300lgQ1ERP8 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cd300lgQ1ERP8 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cd300lgQ1ERP8 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cd300lgQ1ERP8 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Cd300lgQ1ERP8 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cd300lgQ1ERP8 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cd300lgQ1ERP8 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cd300lgQ1ERP8 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cd300lgQ1ERP8 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cd300lgQ1ERP8 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cd300lgQ1ERP8 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Cd300lgQ1ERP8 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cd300lgQ1ERP8 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cd300lgQ1ERP8 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Cd300lgQ1ERP8 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cd300lgQ1ERP8 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cd300lgQ1ERP8 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cd300lgQ1ERP8 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cd300lgQ1ERP8 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cd300lgQ1ERP8 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cd300lgQ1ERP8 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Cd300lgQ1ERP8 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cd300lgQ1ERP8 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cd300lgQ1ERP8 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Cd300lgQ1ERP8 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cd300lgQ1ERP8 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Cd300lgQ1ERP8 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cd300lgQ1ERP8 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cd300lgQ1ERP8 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cd300lgQ1ERP8 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cd300lgQ1ERP8 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cd300lgQ1ERP8 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cd300lgQ1ERP8 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cd300lgQ1ERP8 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cd300lgQ1ERP8 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cd300lgQ1ERP8 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cd300lgQ1ERP8 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cd300lgQ1ERP8 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cd300lgQ1ERP8 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms