Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Itgb8Q0VBD0 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Itgb8Q0VBD0 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Itgb8Q0VBD0 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Itgb8Q0VBD0 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Itgb8Q0VBD0 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Itgb8Q0VBD0 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Itgb8Q0VBD0 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Itgb8Q0VBD0 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Itgb8Q0VBD0 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Itgb8Q0VBD0 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Itgb8Q0VBD0 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Itgb8Q0VBD0 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Itgb8Q0VBD0 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Itgb8Q0VBD0 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Itgb8Q0VBD0 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Itgb8Q0VBD0 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Itgb8Q0VBD0 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Itgb8Q0VBD0 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Itgb8Q0VBD0 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Itgb8Q0VBD0 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Itgb8Q0VBD0 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Itgb8Q0VBD0 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Itgb8Q0VBD0 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Itgb8Q0VBD0 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Itgb8Q0VBD0 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Itgb8Q0VBD0 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Itgb8Q0VBD0 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Itgb8Q0VBD0 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Itgb8Q0VBD0 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Itgb8Q0VBD0 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Itgb8Q0VBD0 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Itgb8Q0VBD0 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Itgb8Q0VBD0 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Itgb8Q0VBD0 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Itgb8Q0VBD0 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Itgb8Q0VBD0 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Itgb8Q0VBD0 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Itgb8Q0VBD0 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Itgb8Q0VBD0 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Itgb8Q0VBD0 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Itgb8Q0VBD0 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Itgb8Q0VBD0 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Itgb8Q0VBD0 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Itgb8Q0VBD0 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Itgb8Q0VBD0 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Itgb8Q0VBD0 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Itgb8Q0VBD0 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Itgb8Q0VBD0 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Itgb8Q0VBD0 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Itgb8Q0VBD0 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Itgb8Q0VBD0 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Itgb8Q0VBD0 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Itgb8Q0VBD0 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Itgb8Q0VBD0 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Itgb8Q0VBD0 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Itgb8Q0VBD0 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Itgb8Q0VBD0 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Itgb8Q0VBD0 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Itgb8Q0VBD0 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Itgb8Q0VBD0 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Itgb8Q0VBD0 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Itgb8Q0VBD0 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Itgb8Q0VBD0 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Itgb8Q0VBD0 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Itgb8Q0VBD0 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Itgb8Q0VBD0 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Itgb8Q0VBD0 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Itgb8Q0VBD0 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Itgb8Q0VBD0 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Itgb8Q0VBD0 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Itgb8Q0VBD0 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Itgb8Q0VBD0 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Itgb8Q0VBD0 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Itgb8Q0VBD0 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Itgb8Q0VBD0 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Itgb8Q0VBD0 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Itgb8Q0VBD0 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Itgb8Q0VBD0 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Itgb8Q0VBD0 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Itgb8Q0VBD0 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Itgb8Q0VBD0 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Itgb8Q0VBD0 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Itgb8Q0VBD0 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Itgb8Q0VBD0 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Itgb8Q0VBD0 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Itgb8Q0VBD0 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Itgb8Q0VBD0 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Itgb8Q0VBD0 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Itgb8Q0VBD0 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Itgb8Q0VBD0 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Itgb8Q0VBD0 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Itgb8Q0VBD0 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Itgb8Q0VBD0 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Itgb8Q0VBD0 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Itgb8Q0VBD0 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Itgb8Q0VBD0 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Itgb8Q0VBD0 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Itgb8Q0VBD0 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Itgb8Q0VBD0 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms