Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T8

Cntnap5b, Contactin-associated protein like 5-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5bQ0V8T8 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cntnap5bQ0V8T8 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cntnap5bQ0V8T8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cntnap5bQ0V8T8 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cntnap5bQ0V8T8 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cntnap5bQ0V8T8 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cntnap5bQ0V8T8 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cntnap5bQ0V8T8 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Cntnap5bQ0V8T8 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cntnap5bQ0V8T8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cntnap5bQ0V8T8 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cntnap5bQ0V8T8 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cntnap5bQ0V8T8 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cntnap5bQ0V8T8 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cntnap5bQ0V8T8 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cntnap5bQ0V8T8 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cntnap5bQ0V8T8 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cntnap5bQ0V8T8 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cntnap5bQ0V8T8 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cntnap5bQ0V8T8 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cntnap5bQ0V8T8 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Cntnap5bQ0V8T8 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cntnap5bQ0V8T8 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cntnap5bQ0V8T8 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cntnap5bQ0V8T8 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cntnap5bQ0V8T8 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cntnap5bQ0V8T8 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cntnap5bQ0V8T8 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cntnap5bQ0V8T8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cntnap5bQ0V8T8 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cntnap5bQ0V8T8 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cntnap5bQ0V8T8 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cntnap5bQ0V8T8 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cntnap5bQ0V8T8 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cntnap5bQ0V8T8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cntnap5bQ0V8T8 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cntnap5bQ0V8T8 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cntnap5bQ0V8T8 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cntnap5bQ0V8T8 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cntnap5bQ0V8T8 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cntnap5bQ0V8T8 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cntnap5bQ0V8T8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cntnap5bQ0V8T8 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cntnap5bQ0V8T8 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cntnap5bQ0V8T8 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Cntnap5bQ0V8T8 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cntnap5bQ0V8T8 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cntnap5bQ0V8T8 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cntnap5bQ0V8T8 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cntnap5bQ0V8T8 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cntnap5bQ0V8T8 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cntnap5bQ0V8T8 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Cntnap5bQ0V8T8 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cntnap5bQ0V8T8 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cntnap5bQ0V8T8 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cntnap5bQ0V8T8 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cntnap5bQ0V8T8 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Cntnap5bQ0V8T8 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cntnap5bQ0V8T8 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cntnap5bQ0V8T8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cntnap5bQ0V8T8 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cntnap5bQ0V8T8 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cntnap5bQ0V8T8 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cntnap5bQ0V8T8 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cntnap5bQ0V8T8 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cntnap5bQ0V8T8 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cntnap5bQ0V8T8 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cntnap5bQ0V8T8 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cntnap5bQ0V8T8 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cntnap5bQ0V8T8 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cntnap5bQ0V8T8 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cntnap5bQ0V8T8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cntnap5bQ0V8T8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cntnap5bQ0V8T8 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cntnap5bQ0V8T8 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cntnap5bQ0V8T8 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cntnap5bQ0V8T8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cntnap5bQ0V8T8 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cntnap5bQ0V8T8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cntnap5bQ0V8T8 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cntnap5bQ0V8T8 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Cntnap5bQ0V8T8 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Cntnap5bQ0V8T8 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cntnap5bQ0V8T8 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Cntnap5bQ0V8T8 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cntnap5bQ0V8T8 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cntnap5bQ0V8T8 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cntnap5bQ0V8T8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cntnap5bQ0V8T8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cntnap5bQ0V8T8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cntnap5bQ0V8T8 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cntnap5bQ0V8T8 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Cntnap5bQ0V8T8 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cntnap5bQ0V8T8 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cntnap5bQ0V8T8 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cntnap5bQ0V8T8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cntnap5bQ0V8T8 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cntnap5bQ0V8T8 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cntnap5bQ0V8T8 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cntnap5bQ0V8T8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms