Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T7

Cntnap5c, Contactin-associated protein like 5-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5cQ0V8T7 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cntnap5cQ0V8T7 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cntnap5cQ0V8T7 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cntnap5cQ0V8T7 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cntnap5cQ0V8T7 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cntnap5cQ0V8T7 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cntnap5cQ0V8T7 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cntnap5cQ0V8T7 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cntnap5cQ0V8T7 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cntnap5cQ0V8T7 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cntnap5cQ0V8T7 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cntnap5cQ0V8T7 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cntnap5cQ0V8T7 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cntnap5cQ0V8T7 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Cntnap5cQ0V8T7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cntnap5cQ0V8T7 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cntnap5cQ0V8T7 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cntnap5cQ0V8T7 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cntnap5cQ0V8T7 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cntnap5cQ0V8T7 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cntnap5cQ0V8T7 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cntnap5cQ0V8T7 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cntnap5cQ0V8T7 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cntnap5cQ0V8T7 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cntnap5cQ0V8T7 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Cntnap5cQ0V8T7 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cntnap5cQ0V8T7 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cntnap5cQ0V8T7 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cntnap5cQ0V8T7 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Cntnap5cQ0V8T7 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cntnap5cQ0V8T7 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cntnap5cQ0V8T7 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cntnap5cQ0V8T7 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cntnap5cQ0V8T7 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cntnap5cQ0V8T7 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cntnap5cQ0V8T7 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cntnap5cQ0V8T7 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cntnap5cQ0V8T7 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cntnap5cQ0V8T7 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cntnap5cQ0V8T7 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cntnap5cQ0V8T7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cntnap5cQ0V8T7 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cntnap5cQ0V8T7 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cntnap5cQ0V8T7 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cntnap5cQ0V8T7 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cntnap5cQ0V8T7 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cntnap5cQ0V8T7 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Cntnap5cQ0V8T7 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Cntnap5cQ0V8T7 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cntnap5cQ0V8T7 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cntnap5cQ0V8T7 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cntnap5cQ0V8T7 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cntnap5cQ0V8T7 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cntnap5cQ0V8T7 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Cntnap5cQ0V8T7 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cntnap5cQ0V8T7 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cntnap5cQ0V8T7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cntnap5cQ0V8T7 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cntnap5cQ0V8T7 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cntnap5cQ0V8T7 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cntnap5cQ0V8T7 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cntnap5cQ0V8T7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cntnap5cQ0V8T7 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cntnap5cQ0V8T7 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cntnap5cQ0V8T7 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cntnap5cQ0V8T7 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cntnap5cQ0V8T7 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cntnap5cQ0V8T7 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cntnap5cQ0V8T7 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cntnap5cQ0V8T7 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cntnap5cQ0V8T7 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Cntnap5cQ0V8T7 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cntnap5cQ0V8T7 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cntnap5cQ0V8T7 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cntnap5cQ0V8T7 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cntnap5cQ0V8T7 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cntnap5cQ0V8T7 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cntnap5cQ0V8T7 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cntnap5cQ0V8T7 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cntnap5cQ0V8T7 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Cntnap5cQ0V8T7 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cntnap5cQ0V8T7 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cntnap5cQ0V8T7 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cntnap5cQ0V8T7 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cntnap5cQ0V8T7 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Cntnap5cQ0V8T7 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cntnap5cQ0V8T7 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cntnap5cQ0V8T7 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cntnap5cQ0V8T7 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cntnap5cQ0V8T7 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cntnap5cQ0V8T7 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cntnap5cQ0V8T7 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cntnap5cQ0V8T7 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cntnap5cQ0V8T7 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cntnap5cQ0V8T7 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cntnap5cQ0V8T7 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cntnap5cQ0V8T7 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cntnap5cQ0V8T7 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cntnap5cQ0V8T7 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cntnap5cQ0V8T7 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms