Protein–RNA interactions for Protein: Q0PD08

Rab42, Ras-related protein Rab-42, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab42Q0PD08 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rab42Q0PD08 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rab42Q0PD08 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rab42Q0PD08 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rab42Q0PD08 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rab42Q0PD08 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rab42Q0PD08 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rab42Q0PD08 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rab42Q0PD08 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rab42Q0PD08 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rab42Q0PD08 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab42Q0PD08 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab42Q0PD08 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab42Q0PD08 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab42Q0PD08 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab42Q0PD08 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab42Q0PD08 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab42Q0PD08 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab42Q0PD08 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab42Q0PD08 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab42Q0PD08 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab42Q0PD08 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab42Q0PD08 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab42Q0PD08 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab42Q0PD08 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab42Q0PD08 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab42Q0PD08 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab42Q0PD08 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab42Q0PD08 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab42Q0PD08 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab42Q0PD08 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab42Q0PD08 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab42Q0PD08 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab42Q0PD08 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab42Q0PD08 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab42Q0PD08 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rab42Q0PD08 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rab42Q0PD08 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rab42Q0PD08 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rab42Q0PD08 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rab42Q0PD08 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rab42Q0PD08 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rab42Q0PD08 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rab42Q0PD08 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rab42Q0PD08 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Rab42Q0PD08 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rab42Q0PD08 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rab42Q0PD08 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rab42Q0PD08 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Rab42Q0PD08 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rab42Q0PD08 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rab42Q0PD08 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rab42Q0PD08 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rab42Q0PD08 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rab42Q0PD08 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rab42Q0PD08 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rab42Q0PD08 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rab42Q0PD08 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rab42Q0PD08 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rab42Q0PD08 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rab42Q0PD08 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rab42Q0PD08 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rab42Q0PD08 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rab42Q0PD08 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rab42Q0PD08 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rab42Q0PD08 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rab42Q0PD08 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rab42Q0PD08 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rab42Q0PD08 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rab42Q0PD08 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rab42Q0PD08 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Rab42Q0PD08 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rab42Q0PD08 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rab42Q0PD08 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rab42Q0PD08 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
Rab42Q0PD08 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Rab42Q0PD08 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rab42Q0PD08 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rab42Q0PD08 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rab42Q0PD08 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rab42Q0PD08 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rab42Q0PD08 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rab42Q0PD08 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rab42Q0PD08 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rab42Q0PD08 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rab42Q0PD08 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rab42Q0PD08 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rab42Q0PD08 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rab42Q0PD08 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rab42Q0PD08 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rab42Q0PD08 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rab42Q0PD08 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rab42Q0PD08 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rab42Q0PD08 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rab42Q0PD08 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rab42Q0PD08 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rab42Q0PD08 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rab42Q0PD08 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rab42Q0PD08 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rab42Q0PD08 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms