Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Vps8Q0P5W1 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
Vps8Q0P5W1 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Vps8Q0P5W1 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Vps8Q0P5W1 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Vps8Q0P5W1 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Vps8Q0P5W1 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Vps8Q0P5W1 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Vps8Q0P5W1 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Vps8Q0P5W1 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Vps8Q0P5W1 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Vps8Q0P5W1 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Vps8Q0P5W1 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Vps8Q0P5W1 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Vps8Q0P5W1 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Vps8Q0P5W1 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
Vps8Q0P5W1 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Vps8Q0P5W1 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
Vps8Q0P5W1 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Vps8Q0P5W1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Vps8Q0P5W1 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
Vps8Q0P5W1 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
Vps8Q0P5W1 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC30■■■□□ 2.39
Vps8Q0P5W1 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Vps8Q0P5W1 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Vps8Q0P5W1 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Vps8Q0P5W1 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
Vps8Q0P5W1 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Vps8Q0P5W1 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Vps8Q0P5W1 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Vps8Q0P5W1 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Vps8Q0P5W1 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Vps8Q0P5W1 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Vps8Q0P5W1 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
Vps8Q0P5W1 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
Vps8Q0P5W1 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Vps8Q0P5W1 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Vps8Q0P5W1 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
Vps8Q0P5W1 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Vps8Q0P5W1 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Vps8Q0P5W1 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Vps8Q0P5W1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Vps8Q0P5W1 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Vps8Q0P5W1 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Vps8Q0P5W1 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Vps8Q0P5W1 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Vps8Q0P5W1 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Vps8Q0P5W1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Vps8Q0P5W1 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Vps8Q0P5W1 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Vps8Q0P5W1 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
Vps8Q0P5W1 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Vps8Q0P5W1 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Vps8Q0P5W1 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
Vps8Q0P5W1 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.38
Vps8Q0P5W1 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Vps8Q0P5W1 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC29.95■■■□□ 2.38
Vps8Q0P5W1 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Vps8Q0P5W1 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Vps8Q0P5W1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Vps8Q0P5W1 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Vps8Q0P5W1 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
Vps8Q0P5W1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Vps8Q0P5W1 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Vps8Q0P5W1 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
Vps8Q0P5W1 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Vps8Q0P5W1 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Vps8Q0P5W1 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Vps8Q0P5W1 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Vps8Q0P5W1 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Vps8Q0P5W1 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Vps8Q0P5W1 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Vps8Q0P5W1 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Vps8Q0P5W1 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Vps8Q0P5W1 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Vps8Q0P5W1 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Vps8Q0P5W1 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Vps8Q0P5W1 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Vps8Q0P5W1 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Vps8Q0P5W1 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Vps8Q0P5W1 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Vps8Q0P5W1 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Vps8Q0P5W1 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Vps8Q0P5W1 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Vps8Q0P5W1 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Vps8Q0P5W1 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Vps8Q0P5W1 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Vps8Q0P5W1 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Vps8Q0P5W1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Vps8Q0P5W1 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Vps8Q0P5W1 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Vps8Q0P5W1 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Vps8Q0P5W1 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
Vps8Q0P5W1 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
Vps8Q0P5W1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Vps8Q0P5W1 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
Vps8Q0P5W1 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Vps8Q0P5W1 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Vps8Q0P5W1 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Vps8Q0P5W1 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms