Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TrioQ0KL02 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TrioQ0KL02 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TrioQ0KL02 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TrioQ0KL02 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
TrioQ0KL02 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
TrioQ0KL02 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
TrioQ0KL02 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
TrioQ0KL02 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TrioQ0KL02 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TrioQ0KL02 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TrioQ0KL02 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TrioQ0KL02 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TrioQ0KL02 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TrioQ0KL02 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TrioQ0KL02 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TrioQ0KL02 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
TrioQ0KL02 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TrioQ0KL02 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
TrioQ0KL02 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TrioQ0KL02 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
TrioQ0KL02 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TrioQ0KL02 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC21■□□□□ 0.95
TrioQ0KL02 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TrioQ0KL02 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TrioQ0KL02 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TrioQ0KL02 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21■□□□□ 0.95
TrioQ0KL02 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TrioQ0KL02 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TrioQ0KL02 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TrioQ0KL02 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TrioQ0KL02 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TrioQ0KL02 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
TrioQ0KL02 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TrioQ0KL02 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TrioQ0KL02 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TrioQ0KL02 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TrioQ0KL02 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TrioQ0KL02 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TrioQ0KL02 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
TrioQ0KL02 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TrioQ0KL02 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TrioQ0KL02 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TrioQ0KL02 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TrioQ0KL02 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TrioQ0KL02 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
TrioQ0KL02 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TrioQ0KL02 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TrioQ0KL02 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TrioQ0KL02 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TrioQ0KL02 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TrioQ0KL02 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TrioQ0KL02 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TrioQ0KL02 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TrioQ0KL02 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TrioQ0KL02 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TrioQ0KL02 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TrioQ0KL02 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TrioQ0KL02 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TrioQ0KL02 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TrioQ0KL02 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.95
TrioQ0KL02 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
TrioQ0KL02 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
TrioQ0KL02 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TrioQ0KL02 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TrioQ0KL02 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TrioQ0KL02 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TrioQ0KL02 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TrioQ0KL02 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TrioQ0KL02 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TrioQ0KL02 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TrioQ0KL02 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TrioQ0KL02 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TrioQ0KL02 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
TrioQ0KL02 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TrioQ0KL02 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TrioQ0KL02 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TrioQ0KL02 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TrioQ0KL02 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TrioQ0KL02 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TrioQ0KL02 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TrioQ0KL02 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TrioQ0KL02 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TrioQ0KL02 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TrioQ0KL02 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
TrioQ0KL02 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TrioQ0KL02 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
TrioQ0KL02 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
TrioQ0KL02 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TrioQ0KL02 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TrioQ0KL02 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TrioQ0KL02 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TrioQ0KL02 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TrioQ0KL02 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TrioQ0KL02 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TrioQ0KL02 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TrioQ0KL02 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TrioQ0KL02 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TrioQ0KL02 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TrioQ0KL02 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms