Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ubxn2bQ0KL01 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ubxn2bQ0KL01 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ubxn2bQ0KL01 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ubxn2bQ0KL01 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ubxn2bQ0KL01 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ubxn2bQ0KL01 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ubxn2bQ0KL01 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ubxn2bQ0KL01 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ubxn2bQ0KL01 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ubxn2bQ0KL01 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ubxn2bQ0KL01 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ubxn2bQ0KL01 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ubxn2bQ0KL01 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Ubxn2bQ0KL01 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ubxn2bQ0KL01 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ubxn2bQ0KL01 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ubxn2bQ0KL01 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ubxn2bQ0KL01 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ubxn2bQ0KL01 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ubxn2bQ0KL01 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ubxn2bQ0KL01 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ubxn2bQ0KL01 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ubxn2bQ0KL01 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ubxn2bQ0KL01 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Ubxn2bQ0KL01 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ubxn2bQ0KL01 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ubxn2bQ0KL01 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ubxn2bQ0KL01 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ubxn2bQ0KL01 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ubxn2bQ0KL01 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ubxn2bQ0KL01 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ubxn2bQ0KL01 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ubxn2bQ0KL01 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ubxn2bQ0KL01 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ubxn2bQ0KL01 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ubxn2bQ0KL01 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ubxn2bQ0KL01 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ubxn2bQ0KL01 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ubxn2bQ0KL01 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ubxn2bQ0KL01 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ubxn2bQ0KL01 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ubxn2bQ0KL01 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ubxn2bQ0KL01 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ubxn2bQ0KL01 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ubxn2bQ0KL01 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ubxn2bQ0KL01 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ubxn2bQ0KL01 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ubxn2bQ0KL01 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ubxn2bQ0KL01 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ubxn2bQ0KL01 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Ubxn2bQ0KL01 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ubxn2bQ0KL01 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ubxn2bQ0KL01 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ubxn2bQ0KL01 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ubxn2bQ0KL01 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ubxn2bQ0KL01 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ubxn2bQ0KL01 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ubxn2bQ0KL01 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ubxn2bQ0KL01 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ubxn2bQ0KL01 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Ubxn2bQ0KL01 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ubxn2bQ0KL01 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ubxn2bQ0KL01 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ubxn2bQ0KL01 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ubxn2bQ0KL01 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Ubxn2bQ0KL01 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ubxn2bQ0KL01 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ubxn2bQ0KL01 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ubxn2bQ0KL01 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Ubxn2bQ0KL01 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Ubxn2bQ0KL01 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ubxn2bQ0KL01 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ubxn2bQ0KL01 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Ubxn2bQ0KL01 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Ubxn2bQ0KL01 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Ubxn2bQ0KL01 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Ubxn2bQ0KL01 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Ubxn2bQ0KL01 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Ubxn2bQ0KL01 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Ubxn2bQ0KL01 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ubxn2bQ0KL01 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ubxn2bQ0KL01 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ubxn2bQ0KL01 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ubxn2bQ0KL01 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ubxn2bQ0KL01 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ubxn2bQ0KL01 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ubxn2bQ0KL01 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ubxn2bQ0KL01 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ubxn2bQ0KL01 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ubxn2bQ0KL01 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ubxn2bQ0KL01 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ubxn2bQ0KL01 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ubxn2bQ0KL01 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ubxn2bQ0KL01 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ubxn2bQ0KL01 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ubxn2bQ0KL01 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ubxn2bQ0KL01 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ubxn2bQ0KL01 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ubxn2bQ0KL01 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms