Protein–RNA interactions for Protein: Q08AU9

UPF0450 protein C17orf58 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q08AU9 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q08AU9 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q08AU9 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q08AU9 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q08AU9 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q08AU9 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q08AU9 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q08AU9 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q08AU9 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q08AU9 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q08AU9 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q08AU9 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q08AU9 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q08AU9 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q08AU9 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q08AU9 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q08AU9 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q08AU9 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Q08AU9 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q08AU9 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q08AU9 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q08AU9 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
Q08AU9 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q08AU9 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q08AU9 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q08AU9 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q08AU9 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q08AU9 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q08AU9 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q08AU9 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q08AU9 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q08AU9 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q08AU9 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q08AU9 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q08AU9 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q08AU9 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q08AU9 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q08AU9 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Q08AU9 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q08AU9 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q08AU9 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q08AU9 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q08AU9 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q08AU9 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q08AU9 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Q08AU9 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q08AU9 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q08AU9 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q08AU9 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q08AU9 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q08AU9 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q08AU9 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q08AU9 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Q08AU9 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q08AU9 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q08AU9 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q08AU9 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q08AU9 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q08AU9 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Q08AU9 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q08AU9 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q08AU9 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q08AU9 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q08AU9 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q08AU9 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q08AU9 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q08AU9 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q08AU9 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q08AU9 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q08AU9 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q08AU9 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q08AU9 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q08AU9 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q08AU9 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q08AU9 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q08AU9 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q08AU9 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q08AU9 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q08AU9 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q08AU9 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q08AU9 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q08AU9 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q08AU9 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q08AU9 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q08AU9 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q08AU9 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q08AU9 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q08AU9 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q08AU9 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q08AU9 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q08AU9 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q08AU9 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q08AU9 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q08AU9 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Q08AU9 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q08AU9 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q08AU9 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q08AU9 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q08AU9 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q08AU9 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms