Protein–RNA interactions for Protein: Q08369

Gata4, Transcription factor GATA-4, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata4Q08369 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gata4Q08369 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gata4Q08369 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gata4Q08369 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gata4Q08369 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gata4Q08369 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gata4Q08369 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gata4Q08369 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gata4Q08369 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gata4Q08369 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gata4Q08369 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gata4Q08369 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gata4Q08369 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gata4Q08369 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gata4Q08369 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gata4Q08369 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gata4Q08369 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gata4Q08369 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gata4Q08369 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gata4Q08369 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gata4Q08369 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gata4Q08369 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Gata4Q08369 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gata4Q08369 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gata4Q08369 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gata4Q08369 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gata4Q08369 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gata4Q08369 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gata4Q08369 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gata4Q08369 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gata4Q08369 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gata4Q08369 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gata4Q08369 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gata4Q08369 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gata4Q08369 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gata4Q08369 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Gata4Q08369 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gata4Q08369 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gata4Q08369 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gata4Q08369 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gata4Q08369 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gata4Q08369 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gata4Q08369 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gata4Q08369 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gata4Q08369 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gata4Q08369 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gata4Q08369 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gata4Q08369 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gata4Q08369 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gata4Q08369 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gata4Q08369 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gata4Q08369 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gata4Q08369 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gata4Q08369 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gata4Q08369 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gata4Q08369 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gata4Q08369 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gata4Q08369 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gata4Q08369 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gata4Q08369 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gata4Q08369 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gata4Q08369 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gata4Q08369 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gata4Q08369 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gata4Q08369 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gata4Q08369 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gata4Q08369 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gata4Q08369 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gata4Q08369 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gata4Q08369 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gata4Q08369 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gata4Q08369 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gata4Q08369 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gata4Q08369 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gata4Q08369 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gata4Q08369 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gata4Q08369 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gata4Q08369 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gata4Q08369 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gata4Q08369 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gata4Q08369 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gata4Q08369 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gata4Q08369 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gata4Q08369 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gata4Q08369 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gata4Q08369 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gata4Q08369 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gata4Q08369 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gata4Q08369 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gata4Q08369 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gata4Q08369 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gata4Q08369 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gata4Q08369 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gata4Q08369 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gata4Q08369 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gata4Q08369 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gata4Q08369 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gata4Q08369 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gata4Q08369 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gata4Q08369 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms