Protein–RNA interactions for Protein: Q07643

Col9a2, Collagen alpha-2(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a2Q07643 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Col9a2Q07643 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Col9a2Q07643 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Col9a2Q07643 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Col9a2Q07643 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Col9a2Q07643 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Col9a2Q07643 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Col9a2Q07643 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Col9a2Q07643 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Col9a2Q07643 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Col9a2Q07643 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Col9a2Q07643 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Col9a2Q07643 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Col9a2Q07643 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Col9a2Q07643 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Col9a2Q07643 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Col9a2Q07643 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Col9a2Q07643 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Col9a2Q07643 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Col9a2Q07643 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Col9a2Q07643 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Col9a2Q07643 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Col9a2Q07643 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Col9a2Q07643 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Col9a2Q07643 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Col9a2Q07643 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Col9a2Q07643 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Col9a2Q07643 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Col9a2Q07643 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Col9a2Q07643 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Col9a2Q07643 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Col9a2Q07643 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Col9a2Q07643 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Col9a2Q07643 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Col9a2Q07643 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Col9a2Q07643 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Col9a2Q07643 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Col9a2Q07643 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Col9a2Q07643 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Col9a2Q07643 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Col9a2Q07643 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Col9a2Q07643 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Col9a2Q07643 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Col9a2Q07643 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Col9a2Q07643 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Col9a2Q07643 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Col9a2Q07643 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Col9a2Q07643 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Col9a2Q07643 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Col9a2Q07643 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Col9a2Q07643 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Col9a2Q07643 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Col9a2Q07643 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Col9a2Q07643 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Col9a2Q07643 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Col9a2Q07643 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Col9a2Q07643 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Col9a2Q07643 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Col9a2Q07643 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Col9a2Q07643 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Col9a2Q07643 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Col9a2Q07643 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Col9a2Q07643 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Col9a2Q07643 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Col9a2Q07643 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Col9a2Q07643 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Col9a2Q07643 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Col9a2Q07643 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Col9a2Q07643 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Col9a2Q07643 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Col9a2Q07643 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Col9a2Q07643 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Col9a2Q07643 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Col9a2Q07643 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Col9a2Q07643 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Col9a2Q07643 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Col9a2Q07643 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Col9a2Q07643 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Col9a2Q07643 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Col9a2Q07643 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Col9a2Q07643 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Col9a2Q07643 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Col9a2Q07643 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Col9a2Q07643 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Col9a2Q07643 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Col9a2Q07643 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Col9a2Q07643 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Col9a2Q07643 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Col9a2Q07643 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Col9a2Q07643 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Col9a2Q07643 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Col9a2Q07643 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Col9a2Q07643 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Col9a2Q07643 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Col9a2Q07643 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Col9a2Q07643 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Col9a2Q07643 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Col9a2Q07643 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Col9a2Q07643 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Col9a2Q07643 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms