Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Siah1bQ06985 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Siah1bQ06985 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Siah1bQ06985 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Siah1bQ06985 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Siah1bQ06985 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Siah1bQ06985 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Siah1bQ06985 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Siah1bQ06985 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Siah1bQ06985 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Siah1bQ06985 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Siah1bQ06985 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Siah1bQ06985 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Siah1bQ06985 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Siah1bQ06985 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Siah1bQ06985 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Siah1bQ06985 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Siah1bQ06985 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Siah1bQ06985 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Siah1bQ06985 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Siah1bQ06985 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Siah1bQ06985 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Siah1bQ06985 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Siah1bQ06985 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Siah1bQ06985 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Siah1bQ06985 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Siah1bQ06985 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Siah1bQ06985 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Siah1bQ06985 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Siah1bQ06985 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Siah1bQ06985 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Siah1bQ06985 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Siah1bQ06985 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Siah1bQ06985 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Siah1bQ06985 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Siah1bQ06985 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Siah1bQ06985 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Siah1bQ06985 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Siah1bQ06985 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Siah1bQ06985 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Siah1bQ06985 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Siah1bQ06985 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Siah1bQ06985 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Siah1bQ06985 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Siah1bQ06985 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Siah1bQ06985 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Siah1bQ06985 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Siah1bQ06985 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Siah1bQ06985 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Siah1bQ06985 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Siah1bQ06985 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Siah1bQ06985 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Siah1bQ06985 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Siah1bQ06985 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Siah1bQ06985 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Siah1bQ06985 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Siah1bQ06985 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Siah1bQ06985 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Siah1bQ06985 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Siah1bQ06985 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Siah1bQ06985 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Siah1bQ06985 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Siah1bQ06985 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Siah1bQ06985 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Siah1bQ06985 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Siah1bQ06985 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Siah1bQ06985 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Siah1bQ06985 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Siah1bQ06985 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Siah1bQ06985 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Siah1bQ06985 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Siah1bQ06985 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Siah1bQ06985 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Siah1bQ06985 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Siah1bQ06985 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Siah1bQ06985 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Siah1bQ06985 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Siah1bQ06985 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Siah1bQ06985 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Siah1bQ06985 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Siah1bQ06985 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Siah1bQ06985 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Siah1bQ06985 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Siah1bQ06985 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Siah1bQ06985 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Siah1bQ06985 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Siah1bQ06985 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Siah1bQ06985 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Siah1bQ06985 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Siah1bQ06985 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Siah1bQ06985 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Siah1bQ06985 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Siah1bQ06985 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Siah1bQ06985 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Siah1bQ06985 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Siah1bQ06985 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Siah1bQ06985 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Siah1bQ06985 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Siah1bQ06985 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Siah1bQ06985 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.6 ms