Protein–RNA interactions for Protein: Q05895

Thbs3, Thrombospondin-3, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs3Q05895 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Thbs3Q05895 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Thbs3Q05895 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Thbs3Q05895 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Thbs3Q05895 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Thbs3Q05895 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Thbs3Q05895 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Thbs3Q05895 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Thbs3Q05895 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Thbs3Q05895 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Thbs3Q05895 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Thbs3Q05895 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Thbs3Q05895 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Thbs3Q05895 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Thbs3Q05895 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Thbs3Q05895 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Thbs3Q05895 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Thbs3Q05895 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Thbs3Q05895 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Thbs3Q05895 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Thbs3Q05895 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Thbs3Q05895 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Thbs3Q05895 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Thbs3Q05895 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Thbs3Q05895 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Thbs3Q05895 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Thbs3Q05895 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Thbs3Q05895 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Thbs3Q05895 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Thbs3Q05895 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Thbs3Q05895 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Thbs3Q05895 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Thbs3Q05895 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Thbs3Q05895 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Thbs3Q05895 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Thbs3Q05895 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Thbs3Q05895 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Thbs3Q05895 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Thbs3Q05895 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Thbs3Q05895 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Thbs3Q05895 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Thbs3Q05895 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Thbs3Q05895 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Thbs3Q05895 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Thbs3Q05895 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Thbs3Q05895 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Thbs3Q05895 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Thbs3Q05895 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Thbs3Q05895 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Thbs3Q05895 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Thbs3Q05895 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Thbs3Q05895 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Thbs3Q05895 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Thbs3Q05895 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Thbs3Q05895 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Thbs3Q05895 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Thbs3Q05895 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Thbs3Q05895 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Thbs3Q05895 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Thbs3Q05895 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Thbs3Q05895 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Thbs3Q05895 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Thbs3Q05895 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Thbs3Q05895 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Thbs3Q05895 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Thbs3Q05895 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Thbs3Q05895 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Thbs3Q05895 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Thbs3Q05895 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Thbs3Q05895 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Thbs3Q05895 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Thbs3Q05895 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Thbs3Q05895 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Thbs3Q05895 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Thbs3Q05895 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Thbs3Q05895 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Thbs3Q05895 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Thbs3Q05895 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Thbs3Q05895 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Thbs3Q05895 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Thbs3Q05895 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Thbs3Q05895 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Thbs3Q05895 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Thbs3Q05895 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Thbs3Q05895 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Thbs3Q05895 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Thbs3Q05895 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Thbs3Q05895 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Thbs3Q05895 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Thbs3Q05895 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Thbs3Q05895 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Thbs3Q05895 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Thbs3Q05895 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Thbs3Q05895 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Thbs3Q05895 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Thbs3Q05895 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Thbs3Q05895 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Thbs3Q05895 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Thbs3Q05895 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Thbs3Q05895 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.3 ms