Protein–RNA interactions for Protein: Q05793

Hspg2, Basement membrane-specific heparan sulfate proteoglycan core protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 3,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hspg2Q05793 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hspg2Q05793 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hspg2Q05793 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hspg2Q05793 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hspg2Q05793 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hspg2Q05793 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hspg2Q05793 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hspg2Q05793 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hspg2Q05793 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hspg2Q05793 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hspg2Q05793 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hspg2Q05793 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hspg2Q05793 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hspg2Q05793 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hspg2Q05793 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hspg2Q05793 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hspg2Q05793 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hspg2Q05793 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hspg2Q05793 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hspg2Q05793 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hspg2Q05793 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hspg2Q05793 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hspg2Q05793 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hspg2Q05793 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hspg2Q05793 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hspg2Q05793 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Hspg2Q05793 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hspg2Q05793 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hspg2Q05793 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hspg2Q05793 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hspg2Q05793 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hspg2Q05793 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hspg2Q05793 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hspg2Q05793 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hspg2Q05793 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hspg2Q05793 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hspg2Q05793 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hspg2Q05793 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hspg2Q05793 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hspg2Q05793 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hspg2Q05793 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hspg2Q05793 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hspg2Q05793 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hspg2Q05793 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hspg2Q05793 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hspg2Q05793 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hspg2Q05793 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hspg2Q05793 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hspg2Q05793 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hspg2Q05793 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hspg2Q05793 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hspg2Q05793 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hspg2Q05793 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hspg2Q05793 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hspg2Q05793 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hspg2Q05793 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hspg2Q05793 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hspg2Q05793 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hspg2Q05793 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hspg2Q05793 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hspg2Q05793 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hspg2Q05793 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hspg2Q05793 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Hspg2Q05793 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hspg2Q05793 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hspg2Q05793 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hspg2Q05793 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hspg2Q05793 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hspg2Q05793 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hspg2Q05793 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Hspg2Q05793 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Hspg2Q05793 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hspg2Q05793 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hspg2Q05793 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Hspg2Q05793 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hspg2Q05793 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hspg2Q05793 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hspg2Q05793 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hspg2Q05793 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hspg2Q05793 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Hspg2Q05793 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hspg2Q05793 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hspg2Q05793 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hspg2Q05793 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hspg2Q05793 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hspg2Q05793 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Hspg2Q05793 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hspg2Q05793 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hspg2Q05793 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hspg2Q05793 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hspg2Q05793 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hspg2Q05793 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hspg2Q05793 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hspg2Q05793 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hspg2Q05793 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hspg2Q05793 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hspg2Q05793 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hspg2Q05793 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hspg2Q05793 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Hspg2Q05793 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms