Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Apoc2Q05020 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Apoc2Q05020 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Apoc2Q05020 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Apoc2Q05020 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Apoc2Q05020 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Apoc2Q05020 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Apoc2Q05020 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Apoc2Q05020 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Apoc2Q05020 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Apoc2Q05020 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Apoc2Q05020 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Apoc2Q05020 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Apoc2Q05020 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Apoc2Q05020 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Apoc2Q05020 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Apoc2Q05020 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apoc2Q05020 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apoc2Q05020 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apoc2Q05020 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apoc2Q05020 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apoc2Q05020 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apoc2Q05020 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apoc2Q05020 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apoc2Q05020 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apoc2Q05020 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Apoc2Q05020 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Apoc2Q05020 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Apoc2Q05020 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Apoc2Q05020 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Apoc2Q05020 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Apoc2Q05020 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Apoc2Q05020 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Apoc2Q05020 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Apoc2Q05020 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Apoc2Q05020 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Apoc2Q05020 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Apoc2Q05020 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Apoc2Q05020 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Apoc2Q05020 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Apoc2Q05020 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Apoc2Q05020 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Apoc2Q05020 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Apoc2Q05020 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Apoc2Q05020 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Apoc2Q05020 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Apoc2Q05020 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Apoc2Q05020 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Apoc2Q05020 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Apoc2Q05020 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Apoc2Q05020 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Apoc2Q05020 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Apoc2Q05020 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Apoc2Q05020 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Apoc2Q05020 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Apoc2Q05020 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Apoc2Q05020 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Apoc2Q05020 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Apoc2Q05020 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Apoc2Q05020 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Apoc2Q05020 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Apoc2Q05020 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Apoc2Q05020 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Apoc2Q05020 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Apoc2Q05020 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Apoc2Q05020 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Apoc2Q05020 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Apoc2Q05020 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Apoc2Q05020 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Apoc2Q05020 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Apoc2Q05020 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Apoc2Q05020 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Apoc2Q05020 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Apoc2Q05020 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Apoc2Q05020 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Apoc2Q05020 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Apoc2Q05020 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Apoc2Q05020 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Apoc2Q05020 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Apoc2Q05020 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Apoc2Q05020 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Apoc2Q05020 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Apoc2Q05020 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Apoc2Q05020 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Apoc2Q05020 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Apoc2Q05020 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Apoc2Q05020 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Apoc2Q05020 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Apoc2Q05020 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Apoc2Q05020 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Apoc2Q05020 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Apoc2Q05020 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Apoc2Q05020 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Apoc2Q05020 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Apoc2Q05020 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Apoc2Q05020 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Apoc2Q05020 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Apoc2Q05020 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Apoc2Q05020 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Apoc2Q05020 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms