Protein–RNA interactions for Protein: Q04899

Cdk18, Cyclin-dependent kinase 18, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk18Q04899 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cdk18Q04899 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cdk18Q04899 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cdk18Q04899 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cdk18Q04899 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cdk18Q04899 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cdk18Q04899 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cdk18Q04899 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cdk18Q04899 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cdk18Q04899 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cdk18Q04899 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cdk18Q04899 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cdk18Q04899 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cdk18Q04899 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cdk18Q04899 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cdk18Q04899 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cdk18Q04899 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cdk18Q04899 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cdk18Q04899 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cdk18Q04899 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cdk18Q04899 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cdk18Q04899 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cdk18Q04899 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cdk18Q04899 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cdk18Q04899 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cdk18Q04899 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cdk18Q04899 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cdk18Q04899 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cdk18Q04899 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cdk18Q04899 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Cdk18Q04899 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cdk18Q04899 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cdk18Q04899 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cdk18Q04899 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cdk18Q04899 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Cdk18Q04899 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cdk18Q04899 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cdk18Q04899 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cdk18Q04899 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cdk18Q04899 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cdk18Q04899 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Cdk18Q04899 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cdk18Q04899 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cdk18Q04899 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cdk18Q04899 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cdk18Q04899 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cdk18Q04899 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cdk18Q04899 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Cdk18Q04899 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cdk18Q04899 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cdk18Q04899 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cdk18Q04899 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cdk18Q04899 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cdk18Q04899 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cdk18Q04899 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cdk18Q04899 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cdk18Q04899 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cdk18Q04899 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cdk18Q04899 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cdk18Q04899 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cdk18Q04899 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cdk18Q04899 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Cdk18Q04899 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cdk18Q04899 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cdk18Q04899 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cdk18Q04899 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cdk18Q04899 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cdk18Q04899 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cdk18Q04899 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cdk18Q04899 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cdk18Q04899 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cdk18Q04899 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cdk18Q04899 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Cdk18Q04899 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cdk18Q04899 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cdk18Q04899 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cdk18Q04899 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cdk18Q04899 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cdk18Q04899 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cdk18Q04899 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cdk18Q04899 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cdk18Q04899 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cdk18Q04899 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cdk18Q04899 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cdk18Q04899 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cdk18Q04899 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cdk18Q04899 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cdk18Q04899 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cdk18Q04899 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cdk18Q04899 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cdk18Q04899 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cdk18Q04899 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cdk18Q04899 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cdk18Q04899 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cdk18Q04899 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cdk18Q04899 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cdk18Q04899 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cdk18Q04899 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cdk18Q04899 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cdk18Q04899 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms