Protein–RNA interactions for Protein: Q04690

Nf1, Neurofibromin, mousemouse

Predictions only

Length 2,841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nf1Q04690 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Nf1Q04690 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nf1Q04690 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nf1Q04690 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nf1Q04690 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nf1Q04690 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nf1Q04690 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nf1Q04690 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nf1Q04690 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nf1Q04690 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nf1Q04690 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nf1Q04690 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nf1Q04690 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nf1Q04690 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nf1Q04690 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nf1Q04690 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nf1Q04690 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nf1Q04690 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nf1Q04690 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nf1Q04690 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nf1Q04690 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nf1Q04690 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nf1Q04690 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nf1Q04690 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nf1Q04690 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Nf1Q04690 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nf1Q04690 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nf1Q04690 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nf1Q04690 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nf1Q04690 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nf1Q04690 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nf1Q04690 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nf1Q04690 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nf1Q04690 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nf1Q04690 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Nf1Q04690 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nf1Q04690 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nf1Q04690 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nf1Q04690 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nf1Q04690 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nf1Q04690 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nf1Q04690 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nf1Q04690 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nf1Q04690 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nf1Q04690 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nf1Q04690 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nf1Q04690 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nf1Q04690 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nf1Q04690 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nf1Q04690 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nf1Q04690 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nf1Q04690 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nf1Q04690 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nf1Q04690 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nf1Q04690 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nf1Q04690 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nf1Q04690 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nf1Q04690 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nf1Q04690 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nf1Q04690 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nf1Q04690 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nf1Q04690 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nf1Q04690 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nf1Q04690 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nf1Q04690 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nf1Q04690 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nf1Q04690 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nf1Q04690 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nf1Q04690 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nf1Q04690 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nf1Q04690 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nf1Q04690 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nf1Q04690 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Nf1Q04690 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nf1Q04690 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nf1Q04690 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nf1Q04690 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nf1Q04690 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nf1Q04690 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nf1Q04690 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nf1Q04690 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nf1Q04690 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nf1Q04690 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nf1Q04690 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nf1Q04690 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nf1Q04690 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nf1Q04690 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nf1Q04690 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nf1Q04690 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nf1Q04690 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nf1Q04690 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nf1Q04690 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nf1Q04690 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nf1Q04690 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nf1Q04690 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nf1Q04690 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nf1Q04690 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nf1Q04690 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nf1Q04690 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nf1Q04690 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms