Protein–RNA interactions for Protein: Q02956

Prkcz, Protein kinase C zeta type, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkczQ02956 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PrkczQ02956 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PrkczQ02956 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PrkczQ02956 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PrkczQ02956 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PrkczQ02956 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PrkczQ02956 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PrkczQ02956 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PrkczQ02956 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PrkczQ02956 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PrkczQ02956 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PrkczQ02956 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PrkczQ02956 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PrkczQ02956 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PrkczQ02956 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PrkczQ02956 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PrkczQ02956 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PrkczQ02956 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PrkczQ02956 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PrkczQ02956 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PrkczQ02956 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PrkczQ02956 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PrkczQ02956 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PrkczQ02956 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PrkczQ02956 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PrkczQ02956 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PrkczQ02956 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PrkczQ02956 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PrkczQ02956 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PrkczQ02956 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PrkczQ02956 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PrkczQ02956 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PrkczQ02956 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PrkczQ02956 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PrkczQ02956 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PrkczQ02956 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PrkczQ02956 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PrkczQ02956 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PrkczQ02956 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PrkczQ02956 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PrkczQ02956 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PrkczQ02956 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PrkczQ02956 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PrkczQ02956 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PrkczQ02956 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PrkczQ02956 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PrkczQ02956 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PrkczQ02956 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PrkczQ02956 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PrkczQ02956 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PrkczQ02956 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PrkczQ02956 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PrkczQ02956 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PrkczQ02956 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PrkczQ02956 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PrkczQ02956 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PrkczQ02956 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PrkczQ02956 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PrkczQ02956 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PrkczQ02956 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PrkczQ02956 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PrkczQ02956 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PrkczQ02956 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PrkczQ02956 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PrkczQ02956 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PrkczQ02956 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PrkczQ02956 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PrkczQ02956 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PrkczQ02956 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PrkczQ02956 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PrkczQ02956 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PrkczQ02956 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PrkczQ02956 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PrkczQ02956 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PrkczQ02956 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PrkczQ02956 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PrkczQ02956 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PrkczQ02956 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PrkczQ02956 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PrkczQ02956 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PrkczQ02956 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PrkczQ02956 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PrkczQ02956 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PrkczQ02956 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PrkczQ02956 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PrkczQ02956 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PrkczQ02956 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PrkczQ02956 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PrkczQ02956 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PrkczQ02956 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PrkczQ02956 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PrkczQ02956 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PrkczQ02956 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PrkczQ02956 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PrkczQ02956 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PrkczQ02956 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PrkczQ02956 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PrkczQ02956 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PrkczQ02956 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PrkczQ02956 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms