Protein–RNA interactions for Protein: Q02788

Col6a2, Collagen alpha-2(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,034 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a2Q02788 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Col6a2Q02788 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Col6a2Q02788 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Col6a2Q02788 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Col6a2Q02788 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Col6a2Q02788 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Col6a2Q02788 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Col6a2Q02788 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Col6a2Q02788 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Col6a2Q02788 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Col6a2Q02788 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Col6a2Q02788 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Col6a2Q02788 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Col6a2Q02788 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Col6a2Q02788 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Col6a2Q02788 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Col6a2Q02788 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Col6a2Q02788 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Col6a2Q02788 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Col6a2Q02788 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Col6a2Q02788 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Col6a2Q02788 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Col6a2Q02788 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Col6a2Q02788 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Col6a2Q02788 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Col6a2Q02788 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Col6a2Q02788 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Col6a2Q02788 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Col6a2Q02788 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Col6a2Q02788 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Col6a2Q02788 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Col6a2Q02788 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Col6a2Q02788 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Col6a2Q02788 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Col6a2Q02788 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Col6a2Q02788 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Col6a2Q02788 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Col6a2Q02788 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Col6a2Q02788 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Col6a2Q02788 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Col6a2Q02788 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Col6a2Q02788 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Col6a2Q02788 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Col6a2Q02788 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Col6a2Q02788 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Col6a2Q02788 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Col6a2Q02788 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Col6a2Q02788 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Col6a2Q02788 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Col6a2Q02788 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Col6a2Q02788 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Col6a2Q02788 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Col6a2Q02788 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Col6a2Q02788 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Col6a2Q02788 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Col6a2Q02788 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Col6a2Q02788 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Col6a2Q02788 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Col6a2Q02788 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Col6a2Q02788 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Col6a2Q02788 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Col6a2Q02788 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Col6a2Q02788 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Col6a2Q02788 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Col6a2Q02788 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Col6a2Q02788 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Col6a2Q02788 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Col6a2Q02788 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Col6a2Q02788 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Col6a2Q02788 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Col6a2Q02788 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Col6a2Q02788 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Col6a2Q02788 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Col6a2Q02788 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Col6a2Q02788 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Col6a2Q02788 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Col6a2Q02788 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Col6a2Q02788 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Col6a2Q02788 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Col6a2Q02788 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Col6a2Q02788 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Col6a2Q02788 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Col6a2Q02788 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Col6a2Q02788 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Col6a2Q02788 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Col6a2Q02788 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Col6a2Q02788 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Col6a2Q02788 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Col6a2Q02788 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Col6a2Q02788 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Col6a2Q02788 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Col6a2Q02788 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Col6a2Q02788 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Col6a2Q02788 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Col6a2Q02788 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Col6a2Q02788 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Col6a2Q02788 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Col6a2Q02788 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Col6a2Q02788 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Col6a2Q02788 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms