Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NfiaQ02780 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NfiaQ02780 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NfiaQ02780 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NfiaQ02780 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NfiaQ02780 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NfiaQ02780 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NfiaQ02780 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NfiaQ02780 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NfiaQ02780 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NfiaQ02780 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NfiaQ02780 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NfiaQ02780 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NfiaQ02780 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NfiaQ02780 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NfiaQ02780 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NfiaQ02780 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NfiaQ02780 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NfiaQ02780 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NfiaQ02780 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NfiaQ02780 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NfiaQ02780 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NfiaQ02780 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NfiaQ02780 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NfiaQ02780 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NfiaQ02780 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NfiaQ02780 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NfiaQ02780 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NfiaQ02780 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NfiaQ02780 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NfiaQ02780 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NfiaQ02780 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NfiaQ02780 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NfiaQ02780 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NfiaQ02780 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NfiaQ02780 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NfiaQ02780 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NfiaQ02780 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NfiaQ02780 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NfiaQ02780 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NfiaQ02780 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NfiaQ02780 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NfiaQ02780 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NfiaQ02780 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NfiaQ02780 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NfiaQ02780 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NfiaQ02780 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NfiaQ02780 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NfiaQ02780 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NfiaQ02780 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NfiaQ02780 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NfiaQ02780 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NfiaQ02780 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NfiaQ02780 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NfiaQ02780 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NfiaQ02780 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NfiaQ02780 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NfiaQ02780 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NfiaQ02780 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NfiaQ02780 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NfiaQ02780 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NfiaQ02780 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NfiaQ02780 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NfiaQ02780 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NfiaQ02780 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NfiaQ02780 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NfiaQ02780 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NfiaQ02780 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NfiaQ02780 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NfiaQ02780 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NfiaQ02780 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NfiaQ02780 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NfiaQ02780 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NfiaQ02780 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NfiaQ02780 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NfiaQ02780 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NfiaQ02780 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NfiaQ02780 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NfiaQ02780 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NfiaQ02780 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NfiaQ02780 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NfiaQ02780 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NfiaQ02780 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NfiaQ02780 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NfiaQ02780 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NfiaQ02780 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NfiaQ02780 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NfiaQ02780 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NfiaQ02780 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NfiaQ02780 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NfiaQ02780 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NfiaQ02780 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NfiaQ02780 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NfiaQ02780 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NfiaQ02780 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NfiaQ02780 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NfiaQ02780 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NfiaQ02780 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NfiaQ02780 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NfiaQ02780 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms