Protein–RNA interactions for Protein: Q02525

Zfp39, Zinc finger protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp39Q02525 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zfp39Q02525 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zfp39Q02525 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zfp39Q02525 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zfp39Q02525 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zfp39Q02525 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Zfp39Q02525 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zfp39Q02525 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zfp39Q02525 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zfp39Q02525 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zfp39Q02525 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zfp39Q02525 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zfp39Q02525 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Zfp39Q02525 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Zfp39Q02525 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Zfp39Q02525 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Zfp39Q02525 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Zfp39Q02525 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Zfp39Q02525 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Zfp39Q02525 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Zfp39Q02525 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Zfp39Q02525 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zfp39Q02525 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zfp39Q02525 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zfp39Q02525 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zfp39Q02525 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zfp39Q02525 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zfp39Q02525 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zfp39Q02525 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Zfp39Q02525 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Zfp39Q02525 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zfp39Q02525 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zfp39Q02525 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zfp39Q02525 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zfp39Q02525 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zfp39Q02525 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zfp39Q02525 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zfp39Q02525 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zfp39Q02525 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Zfp39Q02525 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Zfp39Q02525 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Zfp39Q02525 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Zfp39Q02525 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Zfp39Q02525 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Zfp39Q02525 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Zfp39Q02525 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Zfp39Q02525 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Zfp39Q02525 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Zfp39Q02525 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Zfp39Q02525 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Zfp39Q02525 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Zfp39Q02525 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Zfp39Q02525 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Zfp39Q02525 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Zfp39Q02525 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Zfp39Q02525 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Zfp39Q02525 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Zfp39Q02525 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Zfp39Q02525 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Zfp39Q02525 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Zfp39Q02525 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Zfp39Q02525 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Zfp39Q02525 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Zfp39Q02525 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Zfp39Q02525 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Zfp39Q02525 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Zfp39Q02525 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Zfp39Q02525 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Zfp39Q02525 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Zfp39Q02525 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Zfp39Q02525 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Zfp39Q02525 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Zfp39Q02525 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Zfp39Q02525 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Zfp39Q02525 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Zfp39Q02525 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Zfp39Q02525 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Zfp39Q02525 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Zfp39Q02525 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Zfp39Q02525 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Zfp39Q02525 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Zfp39Q02525 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Zfp39Q02525 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zfp39Q02525 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zfp39Q02525 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zfp39Q02525 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zfp39Q02525 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Zfp39Q02525 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zfp39Q02525 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zfp39Q02525 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zfp39Q02525 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Zfp39Q02525 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zfp39Q02525 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zfp39Q02525 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zfp39Q02525 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zfp39Q02525 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zfp39Q02525 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zfp39Q02525 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zfp39Q02525 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zfp39Q02525 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms