Protein–RNA interactions for Protein: Q02248

Ctnnb1, Catenin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnb1Q02248 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Ctnnb1Q02248 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ctnnb1Q02248 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ctnnb1Q02248 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ctnnb1Q02248 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ctnnb1Q02248 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ctnnb1Q02248 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ctnnb1Q02248 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Ctnnb1Q02248 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ctnnb1Q02248 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ctnnb1Q02248 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ctnnb1Q02248 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Ctnnb1Q02248 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ctnnb1Q02248 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ctnnb1Q02248 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ctnnb1Q02248 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ctnnb1Q02248 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ctnnb1Q02248 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ctnnb1Q02248 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ctnnb1Q02248 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ctnnb1Q02248 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ctnnb1Q02248 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ctnnb1Q02248 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ctnnb1Q02248 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ctnnb1Q02248 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ctnnb1Q02248 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ctnnb1Q02248 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ctnnb1Q02248 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ctnnb1Q02248 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Ctnnb1Q02248 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ctnnb1Q02248 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ctnnb1Q02248 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ctnnb1Q02248 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ctnnb1Q02248 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ctnnb1Q02248 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ctnnb1Q02248 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ctnnb1Q02248 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ctnnb1Q02248 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ctnnb1Q02248 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ctnnb1Q02248 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ctnnb1Q02248 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ctnnb1Q02248 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ctnnb1Q02248 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Ctnnb1Q02248 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ctnnb1Q02248 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ctnnb1Q02248 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ctnnb1Q02248 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ctnnb1Q02248 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ctnnb1Q02248 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ctnnb1Q02248 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ctnnb1Q02248 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ctnnb1Q02248 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ctnnb1Q02248 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ctnnb1Q02248 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ctnnb1Q02248 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ctnnb1Q02248 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ctnnb1Q02248 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ctnnb1Q02248 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ctnnb1Q02248 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ctnnb1Q02248 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ctnnb1Q02248 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ctnnb1Q02248 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ctnnb1Q02248 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ctnnb1Q02248 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ctnnb1Q02248 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ctnnb1Q02248 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ctnnb1Q02248 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ctnnb1Q02248 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Ctnnb1Q02248 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ctnnb1Q02248 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ctnnb1Q02248 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ctnnb1Q02248 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ctnnb1Q02248 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ctnnb1Q02248 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ctnnb1Q02248 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ctnnb1Q02248 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ctnnb1Q02248 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ctnnb1Q02248 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ctnnb1Q02248 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ctnnb1Q02248 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ctnnb1Q02248 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ctnnb1Q02248 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ctnnb1Q02248 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ctnnb1Q02248 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ctnnb1Q02248 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ctnnb1Q02248 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ctnnb1Q02248 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Ctnnb1Q02248 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ctnnb1Q02248 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ctnnb1Q02248 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ctnnb1Q02248 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ctnnb1Q02248 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ctnnb1Q02248 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ctnnb1Q02248 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Ctnnb1Q02248 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ctnnb1Q02248 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ctnnb1Q02248 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ctnnb1Q02248 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ctnnb1Q02248 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ctnnb1Q02248 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms