Protein–RNA interactions for Protein: Q02111

Prkcq, Protein kinase C theta type, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcqQ02111 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PrkcqQ02111 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PrkcqQ02111 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PrkcqQ02111 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PrkcqQ02111 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PrkcqQ02111 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PrkcqQ02111 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PrkcqQ02111 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PrkcqQ02111 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PrkcqQ02111 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PrkcqQ02111 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PrkcqQ02111 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PrkcqQ02111 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PrkcqQ02111 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PrkcqQ02111 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PrkcqQ02111 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PrkcqQ02111 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PrkcqQ02111 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PrkcqQ02111 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PrkcqQ02111 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PrkcqQ02111 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PrkcqQ02111 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PrkcqQ02111 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PrkcqQ02111 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PrkcqQ02111 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PrkcqQ02111 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PrkcqQ02111 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PrkcqQ02111 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PrkcqQ02111 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PrkcqQ02111 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PrkcqQ02111 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PrkcqQ02111 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PrkcqQ02111 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PrkcqQ02111 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PrkcqQ02111 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PrkcqQ02111 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PrkcqQ02111 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PrkcqQ02111 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PrkcqQ02111 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PrkcqQ02111 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PrkcqQ02111 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PrkcqQ02111 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PrkcqQ02111 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PrkcqQ02111 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PrkcqQ02111 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PrkcqQ02111 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PrkcqQ02111 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PrkcqQ02111 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PrkcqQ02111 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PrkcqQ02111 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PrkcqQ02111 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PrkcqQ02111 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PrkcqQ02111 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PrkcqQ02111 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PrkcqQ02111 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PrkcqQ02111 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PrkcqQ02111 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PrkcqQ02111 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PrkcqQ02111 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PrkcqQ02111 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PrkcqQ02111 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PrkcqQ02111 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PrkcqQ02111 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PrkcqQ02111 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PrkcqQ02111 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PrkcqQ02111 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PrkcqQ02111 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PrkcqQ02111 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PrkcqQ02111 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PrkcqQ02111 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PrkcqQ02111 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PrkcqQ02111 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PrkcqQ02111 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PrkcqQ02111 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PrkcqQ02111 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PrkcqQ02111 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PrkcqQ02111 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PrkcqQ02111 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PrkcqQ02111 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PrkcqQ02111 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PrkcqQ02111 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PrkcqQ02111 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PrkcqQ02111 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PrkcqQ02111 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PrkcqQ02111 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PrkcqQ02111 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PrkcqQ02111 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PrkcqQ02111 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PrkcqQ02111 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PrkcqQ02111 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PrkcqQ02111 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PrkcqQ02111 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PrkcqQ02111 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PrkcqQ02111 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PrkcqQ02111 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PrkcqQ02111 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PrkcqQ02111 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PrkcqQ02111 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PrkcqQ02111 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PrkcqQ02111 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms