Protein–RNA interactions for Protein: Q02053

Uba1, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,058 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uba1Q02053 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Uba1Q02053 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Uba1Q02053 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Uba1Q02053 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Uba1Q02053 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Uba1Q02053 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Uba1Q02053 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Uba1Q02053 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Uba1Q02053 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Uba1Q02053 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Uba1Q02053 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Uba1Q02053 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Uba1Q02053 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Uba1Q02053 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Uba1Q02053 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Uba1Q02053 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Uba1Q02053 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Uba1Q02053 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Uba1Q02053 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Uba1Q02053 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Uba1Q02053 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Uba1Q02053 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Uba1Q02053 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Uba1Q02053 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Uba1Q02053 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Uba1Q02053 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Uba1Q02053 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Uba1Q02053 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Uba1Q02053 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Uba1Q02053 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Uba1Q02053 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Uba1Q02053 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Uba1Q02053 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Uba1Q02053 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Uba1Q02053 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Uba1Q02053 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Uba1Q02053 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Uba1Q02053 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Uba1Q02053 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Uba1Q02053 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Uba1Q02053 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Uba1Q02053 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Uba1Q02053 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Uba1Q02053 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Uba1Q02053 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Uba1Q02053 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Uba1Q02053 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Uba1Q02053 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Uba1Q02053 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Uba1Q02053 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Uba1Q02053 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Uba1Q02053 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Uba1Q02053 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Uba1Q02053 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Uba1Q02053 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Uba1Q02053 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Uba1Q02053 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Uba1Q02053 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Uba1Q02053 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Uba1Q02053 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Uba1Q02053 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Uba1Q02053 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Uba1Q02053 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Uba1Q02053 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Uba1Q02053 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Uba1Q02053 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Uba1Q02053 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Uba1Q02053 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Uba1Q02053 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Uba1Q02053 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Uba1Q02053 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Uba1Q02053 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Uba1Q02053 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Uba1Q02053 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Uba1Q02053 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Uba1Q02053 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Uba1Q02053 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Uba1Q02053 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Uba1Q02053 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Uba1Q02053 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Uba1Q02053 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Uba1Q02053 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Uba1Q02053 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Uba1Q02053 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Uba1Q02053 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Uba1Q02053 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Uba1Q02053 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Uba1Q02053 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Uba1Q02053 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Uba1Q02053 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Uba1Q02053 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Uba1Q02053 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Uba1Q02053 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Uba1Q02053 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Uba1Q02053 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Uba1Q02053 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Uba1Q02053 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Uba1Q02053 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Uba1Q02053 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Uba1Q02053 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms