Protein–RNA interactions for Protein: Q01887

Ryk, Tyrosine-protein kinase RYK, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RykQ01887 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RykQ01887 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RykQ01887 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RykQ01887 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RykQ01887 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RykQ01887 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RykQ01887 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RykQ01887 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RykQ01887 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RykQ01887 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RykQ01887 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RykQ01887 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RykQ01887 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RykQ01887 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RykQ01887 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RykQ01887 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RykQ01887 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RykQ01887 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RykQ01887 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RykQ01887 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RykQ01887 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RykQ01887 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RykQ01887 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RykQ01887 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RykQ01887 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RykQ01887 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RykQ01887 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RykQ01887 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RykQ01887 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RykQ01887 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RykQ01887 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RykQ01887 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RykQ01887 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RykQ01887 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RykQ01887 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RykQ01887 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RykQ01887 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
RykQ01887 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RykQ01887 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RykQ01887 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RykQ01887 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RykQ01887 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RykQ01887 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RykQ01887 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RykQ01887 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RykQ01887 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RykQ01887 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
RykQ01887 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RykQ01887 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RykQ01887 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RykQ01887 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RykQ01887 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RykQ01887 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RykQ01887 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RykQ01887 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
RykQ01887 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RykQ01887 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RykQ01887 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RykQ01887 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RykQ01887 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RykQ01887 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
RykQ01887 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
RykQ01887 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RykQ01887 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RykQ01887 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RykQ01887 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RykQ01887 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RykQ01887 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RykQ01887 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RykQ01887 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RykQ01887 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RykQ01887 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RykQ01887 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RykQ01887 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RykQ01887 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RykQ01887 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RykQ01887 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RykQ01887 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RykQ01887 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RykQ01887 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RykQ01887 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RykQ01887 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RykQ01887 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RykQ01887 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RykQ01887 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RykQ01887 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RykQ01887 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RykQ01887 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RykQ01887 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RykQ01887 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RykQ01887 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RykQ01887 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RykQ01887 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RykQ01887 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RykQ01887 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RykQ01887 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RykQ01887 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RykQ01887 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RykQ01887 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RykQ01887 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms