Protein–RNA interactions for Protein: Q01768

Nme2, Nucleoside diphosphate kinase B, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme2Q01768 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Nme2Q01768 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nme2Q01768 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nme2Q01768 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nme2Q01768 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nme2Q01768 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nme2Q01768 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nme2Q01768 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nme2Q01768 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nme2Q01768 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nme2Q01768 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nme2Q01768 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nme2Q01768 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nme2Q01768 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nme2Q01768 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nme2Q01768 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nme2Q01768 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nme2Q01768 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nme2Q01768 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nme2Q01768 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nme2Q01768 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nme2Q01768 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nme2Q01768 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nme2Q01768 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nme2Q01768 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nme2Q01768 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nme2Q01768 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nme2Q01768 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nme2Q01768 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nme2Q01768 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nme2Q01768 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Nme2Q01768 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nme2Q01768 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nme2Q01768 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nme2Q01768 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nme2Q01768 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nme2Q01768 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Nme2Q01768 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Nme2Q01768 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nme2Q01768 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nme2Q01768 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nme2Q01768 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nme2Q01768 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nme2Q01768 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nme2Q01768 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nme2Q01768 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nme2Q01768 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nme2Q01768 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nme2Q01768 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nme2Q01768 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Nme2Q01768 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nme2Q01768 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Nme2Q01768 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nme2Q01768 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nme2Q01768 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nme2Q01768 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nme2Q01768 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nme2Q01768 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nme2Q01768 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nme2Q01768 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nme2Q01768 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nme2Q01768 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Nme2Q01768 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nme2Q01768 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nme2Q01768 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nme2Q01768 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nme2Q01768 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nme2Q01768 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nme2Q01768 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nme2Q01768 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nme2Q01768 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nme2Q01768 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nme2Q01768 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nme2Q01768 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nme2Q01768 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nme2Q01768 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nme2Q01768 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nme2Q01768 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nme2Q01768 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nme2Q01768 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nme2Q01768 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nme2Q01768 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nme2Q01768 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nme2Q01768 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Nme2Q01768 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nme2Q01768 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nme2Q01768 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Nme2Q01768 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Nme2Q01768 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Nme2Q01768 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nme2Q01768 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nme2Q01768 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nme2Q01768 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Nme2Q01768 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nme2Q01768 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nme2Q01768 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nme2Q01768 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nme2Q01768 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nme2Q01768 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nme2Q01768 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms