Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mc1rQ01727 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mc1rQ01727 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mc1rQ01727 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mc1rQ01727 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mc1rQ01727 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mc1rQ01727 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mc1rQ01727 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mc1rQ01727 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mc1rQ01727 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mc1rQ01727 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Mc1rQ01727 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Mc1rQ01727 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mc1rQ01727 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mc1rQ01727 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mc1rQ01727 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mc1rQ01727 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mc1rQ01727 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mc1rQ01727 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mc1rQ01727 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mc1rQ01727 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mc1rQ01727 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mc1rQ01727 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mc1rQ01727 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Mc1rQ01727 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Mc1rQ01727 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Mc1rQ01727 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Mc1rQ01727 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Mc1rQ01727 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Mc1rQ01727 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Mc1rQ01727 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Mc1rQ01727 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Mc1rQ01727 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Mc1rQ01727 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Mc1rQ01727 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Mc1rQ01727 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Mc1rQ01727 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Mc1rQ01727 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Mc1rQ01727 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Mc1rQ01727 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mc1rQ01727 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mc1rQ01727 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Mc1rQ01727 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mc1rQ01727 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mc1rQ01727 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mc1rQ01727 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mc1rQ01727 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mc1rQ01727 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mc1rQ01727 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mc1rQ01727 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mc1rQ01727 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mc1rQ01727 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mc1rQ01727 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mc1rQ01727 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mc1rQ01727 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mc1rQ01727 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Mc1rQ01727 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mc1rQ01727 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mc1rQ01727 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mc1rQ01727 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mc1rQ01727 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mc1rQ01727 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mc1rQ01727 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mc1rQ01727 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mc1rQ01727 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mc1rQ01727 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Mc1rQ01727 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mc1rQ01727 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mc1rQ01727 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mc1rQ01727 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mc1rQ01727 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mc1rQ01727 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mc1rQ01727 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mc1rQ01727 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mc1rQ01727 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mc1rQ01727 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mc1rQ01727 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mc1rQ01727 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mc1rQ01727 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mc1rQ01727 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mc1rQ01727 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Mc1rQ01727 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mc1rQ01727 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mc1rQ01727 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mc1rQ01727 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mc1rQ01727 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mc1rQ01727 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mc1rQ01727 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mc1rQ01727 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mc1rQ01727 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mc1rQ01727 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mc1rQ01727 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mc1rQ01727 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mc1rQ01727 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mc1rQ01727 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Mc1rQ01727 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mc1rQ01727 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mc1rQ01727 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mc1rQ01727 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mc1rQ01727 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms