Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Top2aQ01320 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Top2aQ01320 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Top2aQ01320 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Top2aQ01320 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Top2aQ01320 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Top2aQ01320 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Top2aQ01320 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
Top2aQ01320 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
Top2aQ01320 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Top2aQ01320 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
Top2aQ01320 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC33.23■■■□□ 2.91
Top2aQ01320 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Top2aQ01320 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
Top2aQ01320 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Top2aQ01320 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Top2aQ01320 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Top2aQ01320 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Top2aQ01320 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
Top2aQ01320 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Top2aQ01320 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.21■■■□□ 2.91
Top2aQ01320 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
Top2aQ01320 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
Top2aQ01320 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Top2aQ01320 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Top2aQ01320 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
Top2aQ01320 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Top2aQ01320 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Top2aQ01320 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Top2aQ01320 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Top2aQ01320 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Top2aQ01320 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Top2aQ01320 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Top2aQ01320 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Top2aQ01320 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Top2aQ01320 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Top2aQ01320 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Top2aQ01320 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Top2aQ01320 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Top2aQ01320 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Top2aQ01320 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Top2aQ01320 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Top2aQ01320 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Top2aQ01320 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
Top2aQ01320 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Top2aQ01320 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Top2aQ01320 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
Top2aQ01320 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Top2aQ01320 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC33.15■■■□□ 2.9
Top2aQ01320 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Top2aQ01320 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Top2aQ01320 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Top2aQ01320 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Top2aQ01320 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Top2aQ01320 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Top2aQ01320 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Top2aQ01320 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Top2aQ01320 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Top2aQ01320 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Top2aQ01320 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Top2aQ01320 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Top2aQ01320 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Top2aQ01320 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Top2aQ01320 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Top2aQ01320 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Top2aQ01320 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Top2aQ01320 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Top2aQ01320 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Top2aQ01320 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Top2aQ01320 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
Top2aQ01320 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Top2aQ01320 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
Top2aQ01320 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Top2aQ01320 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Top2aQ01320 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Top2aQ01320 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Top2aQ01320 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Top2aQ01320 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Top2aQ01320 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Top2aQ01320 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Top2aQ01320 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Top2aQ01320 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Top2aQ01320 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Top2aQ01320 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
Top2aQ01320 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
Top2aQ01320 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Top2aQ01320 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Top2aQ01320 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Top2aQ01320 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC33.07■■■□□ 2.88
Top2aQ01320 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
Top2aQ01320 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Top2aQ01320 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Top2aQ01320 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
Top2aQ01320 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Top2aQ01320 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Top2aQ01320 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Top2aQ01320 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
Top2aQ01320 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Top2aQ01320 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Top2aQ01320 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms