Protein–RNA interactions for Protein: Q01231

Gja5, Gap junction alpha-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja5Q01231 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gja5Q01231 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gja5Q01231 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gja5Q01231 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gja5Q01231 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gja5Q01231 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gja5Q01231 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gja5Q01231 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gja5Q01231 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gja5Q01231 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gja5Q01231 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gja5Q01231 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gja5Q01231 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gja5Q01231 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gja5Q01231 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gja5Q01231 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gja5Q01231 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gja5Q01231 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gja5Q01231 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gja5Q01231 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gja5Q01231 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gja5Q01231 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gja5Q01231 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gja5Q01231 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gja5Q01231 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Gja5Q01231 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gja5Q01231 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gja5Q01231 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gja5Q01231 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gja5Q01231 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gja5Q01231 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gja5Q01231 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gja5Q01231 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gja5Q01231 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gja5Q01231 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gja5Q01231 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gja5Q01231 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gja5Q01231 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Gja5Q01231 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gja5Q01231 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Gja5Q01231 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gja5Q01231 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gja5Q01231 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gja5Q01231 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gja5Q01231 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gja5Q01231 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gja5Q01231 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gja5Q01231 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gja5Q01231 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Gja5Q01231 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gja5Q01231 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gja5Q01231 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gja5Q01231 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gja5Q01231 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gja5Q01231 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gja5Q01231 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gja5Q01231 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gja5Q01231 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gja5Q01231 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gja5Q01231 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gja5Q01231 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gja5Q01231 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Gja5Q01231 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Gja5Q01231 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gja5Q01231 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gja5Q01231 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gja5Q01231 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gja5Q01231 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gja5Q01231 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Gja5Q01231 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Gja5Q01231 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Gja5Q01231 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gja5Q01231 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Gja5Q01231 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gja5Q01231 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gja5Q01231 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gja5Q01231 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gja5Q01231 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gja5Q01231 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Gja5Q01231 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gja5Q01231 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gja5Q01231 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gja5Q01231 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gja5Q01231 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gja5Q01231 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gja5Q01231 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Gja5Q01231 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gja5Q01231 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gja5Q01231 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gja5Q01231 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gja5Q01231 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gja5Q01231 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gja5Q01231 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gja5Q01231 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gja5Q01231 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gja5Q01231 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Gja5Q01231 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gja5Q01231 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Gja5Q01231 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gja5Q01231 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms