Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rbp4Q00724 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rbp4Q00724 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rbp4Q00724 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rbp4Q00724 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rbp4Q00724 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rbp4Q00724 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rbp4Q00724 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rbp4Q00724 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Rbp4Q00724 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rbp4Q00724 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rbp4Q00724 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rbp4Q00724 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Rbp4Q00724 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Rbp4Q00724 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rbp4Q00724 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rbp4Q00724 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rbp4Q00724 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rbp4Q00724 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rbp4Q00724 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rbp4Q00724 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rbp4Q00724 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rbp4Q00724 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Rbp4Q00724 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rbp4Q00724 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rbp4Q00724 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rbp4Q00724 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rbp4Q00724 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rbp4Q00724 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rbp4Q00724 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rbp4Q00724 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rbp4Q00724 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Rbp4Q00724 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rbp4Q00724 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rbp4Q00724 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rbp4Q00724 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rbp4Q00724 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rbp4Q00724 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rbp4Q00724 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rbp4Q00724 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rbp4Q00724 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rbp4Q00724 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rbp4Q00724 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rbp4Q00724 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rbp4Q00724 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Rbp4Q00724 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rbp4Q00724 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rbp4Q00724 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rbp4Q00724 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rbp4Q00724 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rbp4Q00724 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rbp4Q00724 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rbp4Q00724 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Rbp4Q00724 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rbp4Q00724 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rbp4Q00724 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rbp4Q00724 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rbp4Q00724 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rbp4Q00724 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rbp4Q00724 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rbp4Q00724 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rbp4Q00724 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rbp4Q00724 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rbp4Q00724 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Rbp4Q00724 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Rbp4Q00724 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rbp4Q00724 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rbp4Q00724 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rbp4Q00724 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rbp4Q00724 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rbp4Q00724 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rbp4Q00724 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rbp4Q00724 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rbp4Q00724 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rbp4Q00724 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rbp4Q00724 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rbp4Q00724 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rbp4Q00724 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rbp4Q00724 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rbp4Q00724 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rbp4Q00724 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rbp4Q00724 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rbp4Q00724 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rbp4Q00724 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rbp4Q00724 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rbp4Q00724 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rbp4Q00724 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rbp4Q00724 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rbp4Q00724 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rbp4Q00724 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rbp4Q00724 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rbp4Q00724 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rbp4Q00724 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rbp4Q00724 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rbp4Q00724 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rbp4Q00724 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rbp4Q00724 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rbp4Q00724 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rbp4Q00724 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rbp4Q00724 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.7 ms