Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Itga4Q00651 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Itga4Q00651 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Itga4Q00651 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Itga4Q00651 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Itga4Q00651 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Itga4Q00651 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Itga4Q00651 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Itga4Q00651 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Itga4Q00651 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Itga4Q00651 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Itga4Q00651 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Itga4Q00651 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Itga4Q00651 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Itga4Q00651 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Itga4Q00651 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Itga4Q00651 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Itga4Q00651 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Itga4Q00651 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Itga4Q00651 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Itga4Q00651 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Itga4Q00651 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Itga4Q00651 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Itga4Q00651 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Itga4Q00651 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Itga4Q00651 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Itga4Q00651 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Itga4Q00651 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Itga4Q00651 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Itga4Q00651 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Itga4Q00651 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Itga4Q00651 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Itga4Q00651 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Itga4Q00651 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Itga4Q00651 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Itga4Q00651 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Itga4Q00651 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Itga4Q00651 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Itga4Q00651 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Itga4Q00651 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Itga4Q00651 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Itga4Q00651 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Itga4Q00651 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Itga4Q00651 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Itga4Q00651 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Itga4Q00651 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Itga4Q00651 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Itga4Q00651 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Itga4Q00651 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Itga4Q00651 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Itga4Q00651 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Itga4Q00651 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Itga4Q00651 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Itga4Q00651 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Itga4Q00651 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Itga4Q00651 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Itga4Q00651 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Itga4Q00651 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Itga4Q00651 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Itga4Q00651 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Itga4Q00651 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Itga4Q00651 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Itga4Q00651 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Itga4Q00651 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Itga4Q00651 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Itga4Q00651 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Itga4Q00651 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Itga4Q00651 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Itga4Q00651 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Itga4Q00651 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Itga4Q00651 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Itga4Q00651 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Itga4Q00651 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Itga4Q00651 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Itga4Q00651 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Itga4Q00651 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Itga4Q00651 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Itga4Q00651 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Itga4Q00651 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Itga4Q00651 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Itga4Q00651 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Itga4Q00651 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Itga4Q00651 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Itga4Q00651 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Itga4Q00651 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
Itga4Q00651 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Itga4Q00651 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Itga4Q00651 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Itga4Q00651 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Itga4Q00651 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Itga4Q00651 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Itga4Q00651 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Itga4Q00651 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Itga4Q00651 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Itga4Q00651 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Itga4Q00651 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Itga4Q00651 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Itga4Q00651 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Itga4Q00651 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Itga4Q00651 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms