Protein–RNA interactions for Protein: P98084

Apba2, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 2, mousemouse

Predictions only

Length 750 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba2P98084 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Apba2P98084 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Apba2P98084 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Apba2P98084 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Apba2P98084 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Apba2P98084 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Apba2P98084 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Apba2P98084 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Apba2P98084 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Apba2P98084 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Apba2P98084 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Apba2P98084 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Apba2P98084 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Apba2P98084 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Apba2P98084 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Apba2P98084 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Apba2P98084 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Apba2P98084 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Apba2P98084 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Apba2P98084 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Apba2P98084 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Apba2P98084 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Apba2P98084 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Apba2P98084 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Apba2P98084 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Apba2P98084 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Apba2P98084 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Apba2P98084 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Apba2P98084 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Apba2P98084 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Apba2P98084 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Apba2P98084 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Apba2P98084 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Apba2P98084 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Apba2P98084 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Apba2P98084 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Apba2P98084 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Apba2P98084 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Apba2P98084 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Apba2P98084 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Apba2P98084 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Apba2P98084 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Apba2P98084 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Apba2P98084 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Apba2P98084 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Apba2P98084 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Apba2P98084 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Apba2P98084 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Apba2P98084 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Apba2P98084 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Apba2P98084 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Apba2P98084 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Apba2P98084 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Apba2P98084 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Apba2P98084 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Apba2P98084 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Apba2P98084 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Apba2P98084 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Apba2P98084 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Apba2P98084 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Apba2P98084 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Apba2P98084 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Apba2P98084 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Apba2P98084 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Apba2P98084 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Apba2P98084 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Apba2P98084 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Apba2P98084 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Apba2P98084 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Apba2P98084 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Apba2P98084 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Apba2P98084 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Apba2P98084 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Apba2P98084 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Apba2P98084 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Apba2P98084 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Apba2P98084 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Apba2P98084 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Apba2P98084 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Apba2P98084 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Apba2P98084 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Apba2P98084 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Apba2P98084 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Apba2P98084 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Apba2P98084 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Apba2P98084 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Apba2P98084 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Apba2P98084 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Apba2P98084 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Apba2P98084 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Apba2P98084 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Apba2P98084 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Apba2P98084 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Apba2P98084 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Apba2P98084 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Apba2P98084 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Apba2P98084 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Apba2P98084 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Apba2P98084 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Apba2P98084 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms