Protein–RNA interactions for Protein: P97952

Scn1b, Sodium channel subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn1bP97952 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scn1bP97952 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scn1bP97952 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scn1bP97952 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scn1bP97952 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Scn1bP97952 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Scn1bP97952 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Scn1bP97952 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Scn1bP97952 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Scn1bP97952 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Scn1bP97952 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Scn1bP97952 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Scn1bP97952 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Scn1bP97952 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Scn1bP97952 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Scn1bP97952 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Scn1bP97952 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Scn1bP97952 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Scn1bP97952 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Scn1bP97952 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Scn1bP97952 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Scn1bP97952 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Scn1bP97952 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Scn1bP97952 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Scn1bP97952 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Scn1bP97952 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Scn1bP97952 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Scn1bP97952 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Scn1bP97952 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Scn1bP97952 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Scn1bP97952 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Scn1bP97952 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Scn1bP97952 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Scn1bP97952 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Scn1bP97952 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Scn1bP97952 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Scn1bP97952 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Scn1bP97952 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Scn1bP97952 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Scn1bP97952 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Scn1bP97952 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Scn1bP97952 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Scn1bP97952 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Scn1bP97952 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Scn1bP97952 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Scn1bP97952 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Scn1bP97952 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Scn1bP97952 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Scn1bP97952 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Scn1bP97952 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Scn1bP97952 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Scn1bP97952 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Scn1bP97952 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Scn1bP97952 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Scn1bP97952 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Scn1bP97952 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Scn1bP97952 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Scn1bP97952 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Scn1bP97952 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Scn1bP97952 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Scn1bP97952 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scn1bP97952 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scn1bP97952 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scn1bP97952 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scn1bP97952 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scn1bP97952 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scn1bP97952 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scn1bP97952 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scn1bP97952 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scn1bP97952 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Scn1bP97952 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scn1bP97952 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Scn1bP97952 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Scn1bP97952 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Scn1bP97952 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Scn1bP97952 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Scn1bP97952 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Scn1bP97952 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Scn1bP97952 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Scn1bP97952 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Scn1bP97952 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Scn1bP97952 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Scn1bP97952 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Scn1bP97952 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Scn1bP97952 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Scn1bP97952 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Scn1bP97952 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Scn1bP97952 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scn1bP97952 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scn1bP97952 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scn1bP97952 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scn1bP97952 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scn1bP97952 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scn1bP97952 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scn1bP97952 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scn1bP97952 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scn1bP97952 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scn1bP97952 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scn1bP97952 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scn1bP97952 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms