Protein–RNA interactions for Protein: P84078

Arf1, ADP-ribosylation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf1P84078 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Arf1P84078 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Arf1P84078 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Arf1P84078 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Arf1P84078 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Arf1P84078 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Arf1P84078 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Arf1P84078 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Arf1P84078 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Arf1P84078 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Arf1P84078 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Arf1P84078 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Arf1P84078 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Arf1P84078 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Arf1P84078 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Arf1P84078 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Arf1P84078 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Arf1P84078 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Arf1P84078 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Arf1P84078 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Arf1P84078 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Arf1P84078 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Arf1P84078 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Arf1P84078 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Arf1P84078 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Arf1P84078 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Arf1P84078 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Arf1P84078 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Arf1P84078 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Arf1P84078 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Arf1P84078 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Arf1P84078 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Arf1P84078 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Arf1P84078 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Arf1P84078 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Arf1P84078 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Arf1P84078 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Arf1P84078 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Arf1P84078 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Arf1P84078 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Arf1P84078 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Arf1P84078 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Arf1P84078 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Arf1P84078 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Arf1P84078 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Arf1P84078 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Arf1P84078 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Arf1P84078 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Arf1P84078 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Arf1P84078 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Arf1P84078 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Arf1P84078 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Arf1P84078 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Arf1P84078 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Arf1P84078 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Arf1P84078 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Arf1P84078 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Arf1P84078 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Arf1P84078 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Arf1P84078 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Arf1P84078 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Arf1P84078 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Arf1P84078 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Arf1P84078 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Arf1P84078 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Arf1P84078 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Arf1P84078 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Arf1P84078 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Arf1P84078 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Arf1P84078 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Arf1P84078 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Arf1P84078 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Arf1P84078 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Arf1P84078 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Arf1P84078 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Arf1P84078 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Arf1P84078 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Arf1P84078 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Arf1P84078 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Arf1P84078 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Arf1P84078 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Arf1P84078 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Arf1P84078 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Arf1P84078 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Arf1P84078 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Arf1P84078 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Arf1P84078 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Arf1P84078 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Arf1P84078 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Arf1P84078 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Arf1P84078 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Arf1P84078 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Arf1P84078 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Arf1P84078 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Arf1P84078 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Arf1P84078 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Arf1P84078 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Arf1P84078 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Arf1P84078 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Arf1P84078 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms