Protein–RNA interactions for Protein: P79568

H2-Q6, Class Ib MHC antigen Qa-2, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q6P79568 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
H2-Q6P79568 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
H2-Q6P79568 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
H2-Q6P79568 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
H2-Q6P79568 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
H2-Q6P79568 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
H2-Q6P79568 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
H2-Q6P79568 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
H2-Q6P79568 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
H2-Q6P79568 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
H2-Q6P79568 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
H2-Q6P79568 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
H2-Q6P79568 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
H2-Q6P79568 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
H2-Q6P79568 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
H2-Q6P79568 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
H2-Q6P79568 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
H2-Q6P79568 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
H2-Q6P79568 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
H2-Q6P79568 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
H2-Q6P79568 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
H2-Q6P79568 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
H2-Q6P79568 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.66
H2-Q6P79568 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
H2-Q6P79568 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
H2-Q6P79568 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
H2-Q6P79568 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
H2-Q6P79568 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
H2-Q6P79568 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
H2-Q6P79568 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
H2-Q6P79568 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
H2-Q6P79568 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
H2-Q6P79568 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
H2-Q6P79568 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
H2-Q6P79568 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
H2-Q6P79568 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
H2-Q6P79568 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
H2-Q6P79568 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
H2-Q6P79568 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
H2-Q6P79568 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
H2-Q6P79568 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
H2-Q6P79568 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
H2-Q6P79568 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
H2-Q6P79568 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
H2-Q6P79568 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
H2-Q6P79568 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
H2-Q6P79568 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
H2-Q6P79568 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
H2-Q6P79568 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
H2-Q6P79568 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
H2-Q6P79568 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
H2-Q6P79568 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
H2-Q6P79568 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
H2-Q6P79568 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
H2-Q6P79568 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
H2-Q6P79568 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
H2-Q6P79568 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
H2-Q6P79568 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
H2-Q6P79568 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
H2-Q6P79568 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
H2-Q6P79568 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
H2-Q6P79568 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
H2-Q6P79568 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
H2-Q6P79568 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
H2-Q6P79568 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
H2-Q6P79568 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
H2-Q6P79568 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
H2-Q6P79568 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
H2-Q6P79568 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
H2-Q6P79568 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
H2-Q6P79568 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
H2-Q6P79568 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
H2-Q6P79568 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
H2-Q6P79568 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
H2-Q6P79568 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
H2-Q6P79568 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
H2-Q6P79568 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
H2-Q6P79568 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
H2-Q6P79568 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
H2-Q6P79568 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
H2-Q6P79568 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
H2-Q6P79568 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
H2-Q6P79568 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
H2-Q6P79568 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
H2-Q6P79568 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
H2-Q6P79568 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
H2-Q6P79568 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
H2-Q6P79568 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
H2-Q6P79568 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
H2-Q6P79568 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
H2-Q6P79568 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
H2-Q6P79568 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
H2-Q6P79568 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
H2-Q6P79568 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
H2-Q6P79568 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
H2-Q6P79568 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
H2-Q6P79568 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
H2-Q6P79568 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
H2-Q6P79568 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
H2-Q6P79568 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 233.5 ms