Protein–RNA interactions for Protein: P70704

Atp8a1, Phospholipid-transporting ATPase IA, mousemouse

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8a1P70704 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atp8a1P70704 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atp8a1P70704 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Atp8a1P70704 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atp8a1P70704 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atp8a1P70704 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Atp8a1P70704 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Atp8a1P70704 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Atp8a1P70704 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atp8a1P70704 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atp8a1P70704 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atp8a1P70704 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atp8a1P70704 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atp8a1P70704 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atp8a1P70704 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atp8a1P70704 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atp8a1P70704 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atp8a1P70704 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Atp8a1P70704 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atp8a1P70704 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atp8a1P70704 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atp8a1P70704 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Atp8a1P70704 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atp8a1P70704 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atp8a1P70704 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Atp8a1P70704 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Atp8a1P70704 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Atp8a1P70704 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atp8a1P70704 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atp8a1P70704 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atp8a1P70704 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Atp8a1P70704 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atp8a1P70704 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Atp8a1P70704 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atp8a1P70704 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atp8a1P70704 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atp8a1P70704 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atp8a1P70704 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atp8a1P70704 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Atp8a1P70704 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Atp8a1P70704 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Atp8a1P70704 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Atp8a1P70704 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Atp8a1P70704 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atp8a1P70704 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atp8a1P70704 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atp8a1P70704 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atp8a1P70704 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atp8a1P70704 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atp8a1P70704 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atp8a1P70704 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atp8a1P70704 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atp8a1P70704 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atp8a1P70704 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atp8a1P70704 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atp8a1P70704 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atp8a1P70704 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Atp8a1P70704 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atp8a1P70704 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atp8a1P70704 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atp8a1P70704 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atp8a1P70704 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atp8a1P70704 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atp8a1P70704 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atp8a1P70704 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atp8a1P70704 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atp8a1P70704 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atp8a1P70704 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atp8a1P70704 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atp8a1P70704 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atp8a1P70704 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atp8a1P70704 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atp8a1P70704 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atp8a1P70704 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atp8a1P70704 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atp8a1P70704 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atp8a1P70704 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atp8a1P70704 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atp8a1P70704 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atp8a1P70704 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atp8a1P70704 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atp8a1P70704 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atp8a1P70704 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atp8a1P70704 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atp8a1P70704 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atp8a1P70704 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atp8a1P70704 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atp8a1P70704 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atp8a1P70704 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atp8a1P70704 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atp8a1P70704 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atp8a1P70704 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atp8a1P70704 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Atp8a1P70704 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atp8a1P70704 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atp8a1P70704 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atp8a1P70704 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atp8a1P70704 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atp8a1P70704 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atp8a1P70704 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms