Protein–RNA interactions for Protein: P70671

Irf3, Interferon regulatory factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf3P70671 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Irf3P70671 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Irf3P70671 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Irf3P70671 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Irf3P70671 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Irf3P70671 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Irf3P70671 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Irf3P70671 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Irf3P70671 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Irf3P70671 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Irf3P70671 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Irf3P70671 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Irf3P70671 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Irf3P70671 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Irf3P70671 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Irf3P70671 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Irf3P70671 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Irf3P70671 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Irf3P70671 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Irf3P70671 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Irf3P70671 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Irf3P70671 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Irf3P70671 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Irf3P70671 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Irf3P70671 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Irf3P70671 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Irf3P70671 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Irf3P70671 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Irf3P70671 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Irf3P70671 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Irf3P70671 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Irf3P70671 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Irf3P70671 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Irf3P70671 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Irf3P70671 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Irf3P70671 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Irf3P70671 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Irf3P70671 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Irf3P70671 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Irf3P70671 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Irf3P70671 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Irf3P70671 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Irf3P70671 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Irf3P70671 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Irf3P70671 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Irf3P70671 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Irf3P70671 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Irf3P70671 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Irf3P70671 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Irf3P70671 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Irf3P70671 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Irf3P70671 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Irf3P70671 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Irf3P70671 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Irf3P70671 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Irf3P70671 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Irf3P70671 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Irf3P70671 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Irf3P70671 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Irf3P70671 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Irf3P70671 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Irf3P70671 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Irf3P70671 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Irf3P70671 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Irf3P70671 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Irf3P70671 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Irf3P70671 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Irf3P70671 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Irf3P70671 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Irf3P70671 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Irf3P70671 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Irf3P70671 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Irf3P70671 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Irf3P70671 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Irf3P70671 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Irf3P70671 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Irf3P70671 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Irf3P70671 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Irf3P70671 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Irf3P70671 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Irf3P70671 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Irf3P70671 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Irf3P70671 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Irf3P70671 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Irf3P70671 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Irf3P70671 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Irf3P70671 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Irf3P70671 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Irf3P70671 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Irf3P70671 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Irf3P70671 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Irf3P70671 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Irf3P70671 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Irf3P70671 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Irf3P70671 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Irf3P70671 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Irf3P70671 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Irf3P70671 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Irf3P70671 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Irf3P70671 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms