Protein–RNA interactions for Protein: P70362

Ufd1, Ubiquitin recognition factor in ER-associated degradation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufd1P70362 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ufd1P70362 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ufd1P70362 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ufd1P70362 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ufd1P70362 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ufd1P70362 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ufd1P70362 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ufd1P70362 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ufd1P70362 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ufd1P70362 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ufd1P70362 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ufd1P70362 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ufd1P70362 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ufd1P70362 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ufd1P70362 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ufd1P70362 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ufd1P70362 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ufd1P70362 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ufd1P70362 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ufd1P70362 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ufd1P70362 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ufd1P70362 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ufd1P70362 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ufd1P70362 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ufd1P70362 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ufd1P70362 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ufd1P70362 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ufd1P70362 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ufd1P70362 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ufd1P70362 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ufd1P70362 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ufd1P70362 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ufd1P70362 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ufd1P70362 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ufd1P70362 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ufd1P70362 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ufd1P70362 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ufd1P70362 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ufd1P70362 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Ufd1P70362 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ufd1P70362 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ufd1P70362 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ufd1P70362 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ufd1P70362 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ufd1P70362 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ufd1P70362 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ufd1P70362 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ufd1P70362 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ufd1P70362 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ufd1P70362 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ufd1P70362 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ufd1P70362 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ufd1P70362 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ufd1P70362 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ufd1P70362 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ufd1P70362 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ufd1P70362 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ufd1P70362 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ufd1P70362 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ufd1P70362 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ufd1P70362 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ufd1P70362 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ufd1P70362 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ufd1P70362 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ufd1P70362 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ufd1P70362 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ufd1P70362 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ufd1P70362 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ufd1P70362 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ufd1P70362 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ufd1P70362 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ufd1P70362 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ufd1P70362 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ufd1P70362 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ufd1P70362 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ufd1P70362 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ufd1P70362 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ufd1P70362 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ufd1P70362 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ufd1P70362 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ufd1P70362 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ufd1P70362 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ufd1P70362 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ufd1P70362 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ufd1P70362 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ufd1P70362 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ufd1P70362 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ufd1P70362 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ufd1P70362 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ufd1P70362 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ufd1P70362 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ufd1P70362 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ufd1P70362 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ufd1P70362 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ufd1P70362 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ufd1P70362 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ufd1P70362 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ufd1P70362 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ufd1P70362 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ufd1P70362 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms