Protein–RNA interactions for Protein: P70327

Tbx6, T-box transcription factor TBX6, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbx6P70327 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tbx6P70327 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tbx6P70327 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tbx6P70327 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tbx6P70327 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tbx6P70327 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tbx6P70327 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tbx6P70327 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tbx6P70327 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tbx6P70327 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tbx6P70327 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tbx6P70327 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tbx6P70327 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tbx6P70327 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tbx6P70327 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tbx6P70327 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tbx6P70327 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tbx6P70327 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tbx6P70327 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tbx6P70327 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tbx6P70327 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tbx6P70327 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tbx6P70327 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Tbx6P70327 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tbx6P70327 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tbx6P70327 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tbx6P70327 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tbx6P70327 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tbx6P70327 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tbx6P70327 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tbx6P70327 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tbx6P70327 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tbx6P70327 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tbx6P70327 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tbx6P70327 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tbx6P70327 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Tbx6P70327 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tbx6P70327 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Tbx6P70327 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tbx6P70327 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tbx6P70327 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tbx6P70327 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tbx6P70327 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tbx6P70327 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tbx6P70327 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tbx6P70327 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tbx6P70327 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tbx6P70327 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tbx6P70327 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tbx6P70327 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tbx6P70327 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tbx6P70327 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tbx6P70327 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tbx6P70327 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tbx6P70327 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tbx6P70327 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tbx6P70327 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tbx6P70327 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tbx6P70327 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tbx6P70327 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tbx6P70327 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tbx6P70327 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tbx6P70327 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tbx6P70327 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tbx6P70327 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tbx6P70327 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tbx6P70327 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tbx6P70327 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tbx6P70327 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tbx6P70327 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tbx6P70327 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tbx6P70327 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tbx6P70327 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Tbx6P70327 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tbx6P70327 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tbx6P70327 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Tbx6P70327 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Tbx6P70327 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Tbx6P70327 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Tbx6P70327 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tbx6P70327 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tbx6P70327 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tbx6P70327 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tbx6P70327 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tbx6P70327 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tbx6P70327 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tbx6P70327 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tbx6P70327 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tbx6P70327 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tbx6P70327 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tbx6P70327 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tbx6P70327 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tbx6P70327 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tbx6P70327 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tbx6P70327 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tbx6P70327 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tbx6P70327 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tbx6P70327 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tbx6P70327 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tbx6P70327 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms