Protein–RNA interactions for Protein: P70314

Pitx1, Pituitary homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx1P70314 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pitx1P70314 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pitx1P70314 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pitx1P70314 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pitx1P70314 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pitx1P70314 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pitx1P70314 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pitx1P70314 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pitx1P70314 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pitx1P70314 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pitx1P70314 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pitx1P70314 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Pitx1P70314 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pitx1P70314 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pitx1P70314 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pitx1P70314 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pitx1P70314 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Pitx1P70314 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pitx1P70314 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pitx1P70314 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pitx1P70314 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pitx1P70314 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pitx1P70314 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pitx1P70314 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pitx1P70314 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pitx1P70314 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pitx1P70314 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pitx1P70314 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pitx1P70314 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pitx1P70314 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pitx1P70314 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pitx1P70314 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pitx1P70314 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pitx1P70314 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pitx1P70314 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pitx1P70314 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pitx1P70314 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pitx1P70314 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pitx1P70314 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pitx1P70314 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Pitx1P70314 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pitx1P70314 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pitx1P70314 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pitx1P70314 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pitx1P70314 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pitx1P70314 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pitx1P70314 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pitx1P70314 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pitx1P70314 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pitx1P70314 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pitx1P70314 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pitx1P70314 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pitx1P70314 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pitx1P70314 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pitx1P70314 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pitx1P70314 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pitx1P70314 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pitx1P70314 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pitx1P70314 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pitx1P70314 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pitx1P70314 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Pitx1P70314 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pitx1P70314 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pitx1P70314 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pitx1P70314 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pitx1P70314 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Pitx1P70314 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pitx1P70314 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pitx1P70314 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pitx1P70314 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pitx1P70314 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pitx1P70314 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pitx1P70314 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pitx1P70314 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pitx1P70314 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Pitx1P70314 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pitx1P70314 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pitx1P70314 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pitx1P70314 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pitx1P70314 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pitx1P70314 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Pitx1P70314 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pitx1P70314 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pitx1P70314 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pitx1P70314 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Pitx1P70314 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pitx1P70314 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pitx1P70314 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pitx1P70314 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pitx1P70314 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pitx1P70314 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pitx1P70314 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pitx1P70314 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pitx1P70314 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pitx1P70314 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pitx1P70314 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pitx1P70314 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Pitx1P70314 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Pitx1P70314 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pitx1P70314 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms