Protein–RNA interactions for Protein: P70295

Aup1, Ancient ubiquitous protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aup1P70295 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Aup1P70295 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Aup1P70295 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Aup1P70295 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Aup1P70295 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Aup1P70295 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Aup1P70295 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Aup1P70295 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Aup1P70295 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Aup1P70295 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Aup1P70295 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Aup1P70295 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Aup1P70295 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Aup1P70295 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Aup1P70295 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Aup1P70295 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Aup1P70295 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Aup1P70295 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Aup1P70295 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Aup1P70295 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Aup1P70295 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Aup1P70295 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Aup1P70295 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Aup1P70295 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Aup1P70295 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Aup1P70295 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Aup1P70295 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Aup1P70295 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Aup1P70295 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Aup1P70295 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Aup1P70295 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Aup1P70295 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Aup1P70295 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Aup1P70295 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Aup1P70295 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Aup1P70295 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Aup1P70295 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Aup1P70295 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Aup1P70295 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Aup1P70295 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Aup1P70295 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Aup1P70295 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Aup1P70295 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Aup1P70295 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Aup1P70295 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Aup1P70295 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Aup1P70295 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Aup1P70295 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Aup1P70295 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Aup1P70295 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Aup1P70295 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Aup1P70295 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Aup1P70295 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Aup1P70295 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Aup1P70295 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Aup1P70295 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Aup1P70295 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Aup1P70295 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Aup1P70295 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Aup1P70295 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Aup1P70295 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Aup1P70295 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Aup1P70295 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Aup1P70295 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Aup1P70295 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Aup1P70295 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Aup1P70295 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Aup1P70295 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Aup1P70295 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Aup1P70295 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Aup1P70295 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Aup1P70295 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Aup1P70295 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Aup1P70295 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Aup1P70295 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Aup1P70295 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Aup1P70295 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Aup1P70295 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Aup1P70295 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Aup1P70295 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Aup1P70295 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Aup1P70295 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
Aup1P70295 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Aup1P70295 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Aup1P70295 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Aup1P70295 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Aup1P70295 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Aup1P70295 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Aup1P70295 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Aup1P70295 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Aup1P70295 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Aup1P70295 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Aup1P70295 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Aup1P70295 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Aup1P70295 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Aup1P70295 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Aup1P70295 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Aup1P70295 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Aup1P70295 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Aup1P70295 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms