Protein–RNA interactions for Protein: P68372

Tubb4b, Tubulin beta-4B chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4bP68372 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tubb4bP68372 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tubb4bP68372 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tubb4bP68372 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tubb4bP68372 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tubb4bP68372 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tubb4bP68372 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tubb4bP68372 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tubb4bP68372 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tubb4bP68372 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tubb4bP68372 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tubb4bP68372 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tubb4bP68372 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tubb4bP68372 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tubb4bP68372 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tubb4bP68372 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tubb4bP68372 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tubb4bP68372 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tubb4bP68372 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Tubb4bP68372 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tubb4bP68372 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tubb4bP68372 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tubb4bP68372 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tubb4bP68372 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tubb4bP68372 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tubb4bP68372 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tubb4bP68372 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tubb4bP68372 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tubb4bP68372 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tubb4bP68372 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tubb4bP68372 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tubb4bP68372 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tubb4bP68372 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tubb4bP68372 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tubb4bP68372 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tubb4bP68372 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tubb4bP68372 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tubb4bP68372 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Tubb4bP68372 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Tubb4bP68372 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Tubb4bP68372 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tubb4bP68372 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tubb4bP68372 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tubb4bP68372 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tubb4bP68372 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tubb4bP68372 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tubb4bP68372 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Tubb4bP68372 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tubb4bP68372 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tubb4bP68372 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tubb4bP68372 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tubb4bP68372 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tubb4bP68372 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tubb4bP68372 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tubb4bP68372 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tubb4bP68372 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tubb4bP68372 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tubb4bP68372 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tubb4bP68372 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tubb4bP68372 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tubb4bP68372 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tubb4bP68372 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tubb4bP68372 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tubb4bP68372 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tubb4bP68372 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tubb4bP68372 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tubb4bP68372 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tubb4bP68372 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tubb4bP68372 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tubb4bP68372 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tubb4bP68372 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tubb4bP68372 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tubb4bP68372 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tubb4bP68372 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tubb4bP68372 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tubb4bP68372 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tubb4bP68372 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tubb4bP68372 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tubb4bP68372 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tubb4bP68372 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tubb4bP68372 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tubb4bP68372 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tubb4bP68372 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tubb4bP68372 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tubb4bP68372 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tubb4bP68372 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tubb4bP68372 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tubb4bP68372 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tubb4bP68372 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Tubb4bP68372 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tubb4bP68372 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tubb4bP68372 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tubb4bP68372 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tubb4bP68372 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tubb4bP68372 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tubb4bP68372 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tubb4bP68372 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tubb4bP68372 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tubb4bP68372 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tubb4bP68372 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms