Protein–RNA interactions for Protein: P63254

Crip1, Cysteine-rich protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crip1P63254 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Crip1P63254 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Crip1P63254 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Crip1P63254 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Crip1P63254 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Crip1P63254 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Crip1P63254 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Crip1P63254 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Crip1P63254 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Crip1P63254 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Crip1P63254 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Crip1P63254 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Crip1P63254 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Crip1P63254 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Crip1P63254 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Crip1P63254 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Crip1P63254 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Crip1P63254 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Crip1P63254 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Crip1P63254 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Crip1P63254 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Crip1P63254 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Crip1P63254 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Crip1P63254 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Crip1P63254 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Crip1P63254 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Crip1P63254 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Crip1P63254 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Crip1P63254 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Crip1P63254 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Crip1P63254 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Crip1P63254 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Crip1P63254 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Crip1P63254 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Crip1P63254 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Crip1P63254 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Crip1P63254 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Crip1P63254 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Crip1P63254 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Crip1P63254 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Crip1P63254 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Crip1P63254 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Crip1P63254 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Crip1P63254 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Crip1P63254 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Crip1P63254 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Crip1P63254 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Crip1P63254 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Crip1P63254 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Crip1P63254 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Crip1P63254 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Crip1P63254 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Crip1P63254 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Crip1P63254 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Crip1P63254 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Crip1P63254 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Crip1P63254 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Crip1P63254 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Crip1P63254 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Crip1P63254 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Crip1P63254 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Crip1P63254 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Crip1P63254 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Crip1P63254 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Crip1P63254 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Crip1P63254 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Crip1P63254 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Crip1P63254 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Crip1P63254 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Crip1P63254 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Crip1P63254 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Crip1P63254 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Crip1P63254 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Crip1P63254 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Crip1P63254 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Crip1P63254 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Crip1P63254 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Crip1P63254 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Crip1P63254 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Crip1P63254 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Crip1P63254 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Crip1P63254 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Crip1P63254 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Crip1P63254 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Crip1P63254 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Crip1P63254 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Crip1P63254 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Crip1P63254 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Crip1P63254 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Crip1P63254 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Crip1P63254 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Crip1P63254 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Crip1P63254 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Crip1P63254 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Crip1P63254 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Crip1P63254 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Crip1P63254 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Crip1P63254 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Crip1P63254 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Crip1P63254 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms