Protein–RNA interactions for Protein: P63089

Ptn, Pleiotrophin, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtnP63089 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PtnP63089 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PtnP63089 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PtnP63089 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PtnP63089 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PtnP63089 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PtnP63089 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PtnP63089 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PtnP63089 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PtnP63089 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
PtnP63089 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PtnP63089 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PtnP63089 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PtnP63089 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PtnP63089 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PtnP63089 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PtnP63089 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PtnP63089 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PtnP63089 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PtnP63089 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PtnP63089 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PtnP63089 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PtnP63089 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PtnP63089 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PtnP63089 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PtnP63089 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PtnP63089 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PtnP63089 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PtnP63089 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PtnP63089 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PtnP63089 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PtnP63089 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PtnP63089 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PtnP63089 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PtnP63089 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PtnP63089 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PtnP63089 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PtnP63089 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PtnP63089 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PtnP63089 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PtnP63089 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PtnP63089 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PtnP63089 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PtnP63089 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PtnP63089 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PtnP63089 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PtnP63089 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PtnP63089 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PtnP63089 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PtnP63089 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PtnP63089 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PtnP63089 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PtnP63089 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PtnP63089 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PtnP63089 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PtnP63089 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PtnP63089 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PtnP63089 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PtnP63089 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PtnP63089 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PtnP63089 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PtnP63089 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PtnP63089 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PtnP63089 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PtnP63089 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PtnP63089 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PtnP63089 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PtnP63089 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PtnP63089 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PtnP63089 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PtnP63089 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PtnP63089 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PtnP63089 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PtnP63089 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PtnP63089 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PtnP63089 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PtnP63089 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PtnP63089 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PtnP63089 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PtnP63089 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PtnP63089 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PtnP63089 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PtnP63089 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PtnP63089 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PtnP63089 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PtnP63089 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PtnP63089 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PtnP63089 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PtnP63089 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PtnP63089 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PtnP63089 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PtnP63089 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PtnP63089 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PtnP63089 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PtnP63089 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PtnP63089 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PtnP63089 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PtnP63089 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PtnP63089 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PtnP63089 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms