Protein–RNA interactions for Protein: P62889

Rpl30, 60S ribosomal protein L30, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl30P62889 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpl30P62889 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpl30P62889 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpl30P62889 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpl30P62889 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpl30P62889 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpl30P62889 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpl30P62889 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpl30P62889 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpl30P62889 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpl30P62889 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpl30P62889 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpl30P62889 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpl30P62889 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpl30P62889 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpl30P62889 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpl30P62889 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpl30P62889 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpl30P62889 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpl30P62889 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpl30P62889 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpl30P62889 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpl30P62889 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpl30P62889 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpl30P62889 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpl30P62889 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpl30P62889 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpl30P62889 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpl30P62889 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpl30P62889 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpl30P62889 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpl30P62889 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpl30P62889 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpl30P62889 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpl30P62889 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpl30P62889 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpl30P62889 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpl30P62889 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpl30P62889 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpl30P62889 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpl30P62889 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpl30P62889 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpl30P62889 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpl30P62889 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpl30P62889 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpl30P62889 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpl30P62889 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpl30P62889 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpl30P62889 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpl30P62889 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpl30P62889 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpl30P62889 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpl30P62889 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpl30P62889 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpl30P62889 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpl30P62889 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpl30P62889 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpl30P62889 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpl30P62889 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpl30P62889 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpl30P62889 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpl30P62889 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpl30P62889 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpl30P62889 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpl30P62889 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpl30P62889 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpl30P62889 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpl30P62889 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpl30P62889 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rpl30P62889 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rpl30P62889 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rpl30P62889 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpl30P62889 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpl30P62889 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpl30P62889 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpl30P62889 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpl30P62889 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl30P62889 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl30P62889 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl30P62889 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl30P62889 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl30P62889 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl30P62889 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl30P62889 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl30P62889 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl30P62889 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl30P62889 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl30P62889 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl30P62889 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl30P62889 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl30P62889 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl30P62889 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl30P62889 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl30P62889 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl30P62889 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl30P62889 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl30P62889 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl30P62889 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl30P62889 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl30P62889 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms