Protein–RNA interactions for Protein: P62812

Gabra1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra1P62812 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gabra1P62812 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gabra1P62812 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gabra1P62812 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Gabra1P62812 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gabra1P62812 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gabra1P62812 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gabra1P62812 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gabra1P62812 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gabra1P62812 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gabra1P62812 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gabra1P62812 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gabra1P62812 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gabra1P62812 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gabra1P62812 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gabra1P62812 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gabra1P62812 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gabra1P62812 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gabra1P62812 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gabra1P62812 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gabra1P62812 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gabra1P62812 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gabra1P62812 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gabra1P62812 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gabra1P62812 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gabra1P62812 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gabra1P62812 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gabra1P62812 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gabra1P62812 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gabra1P62812 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gabra1P62812 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gabra1P62812 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gabra1P62812 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gabra1P62812 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gabra1P62812 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gabra1P62812 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gabra1P62812 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gabra1P62812 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gabra1P62812 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gabra1P62812 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Gabra1P62812 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Gabra1P62812 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gabra1P62812 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gabra1P62812 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gabra1P62812 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gabra1P62812 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gabra1P62812 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gabra1P62812 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gabra1P62812 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gabra1P62812 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gabra1P62812 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gabra1P62812 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gabra1P62812 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gabra1P62812 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gabra1P62812 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gabra1P62812 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gabra1P62812 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gabra1P62812 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gabra1P62812 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gabra1P62812 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gabra1P62812 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gabra1P62812 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gabra1P62812 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gabra1P62812 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gabra1P62812 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gabra1P62812 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gabra1P62812 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gabra1P62812 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gabra1P62812 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gabra1P62812 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gabra1P62812 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gabra1P62812 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gabra1P62812 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Gabra1P62812 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Gabra1P62812 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gabra1P62812 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gabra1P62812 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gabra1P62812 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gabra1P62812 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gabra1P62812 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gabra1P62812 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gabra1P62812 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gabra1P62812 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Gabra1P62812 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gabra1P62812 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gabra1P62812 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gabra1P62812 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gabra1P62812 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gabra1P62812 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gabra1P62812 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gabra1P62812 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gabra1P62812 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Gabra1P62812 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gabra1P62812 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gabra1P62812 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gabra1P62812 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gabra1P62812 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gabra1P62812 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Gabra1P62812 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gabra1P62812 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms